Деятельность японской военной разведки во время Боксерского восстания также выявила необходимость организации дополнительного разведывательного пункта в европейской части России, поскольку в июле 1900 г. военный атташе Мурата не смог командировать кого-либо из своих подчиненных в Одессу для уточнения информации о перебросках русских войск на Маньчжурский плацдарм в силу того, что единственный находившийся на тот момент в его подчинении офицер – капитан Танака Гиити – стажировался в Новочеркасском пехотном полку, тогда как посланник Комура Дзютаро все же отправил в Одессу некоего японца123. Поэтому в феврале 1902 г. Генштаб командировал из Владивостока в Одессу под видом изучавшего русский язык коммивояжера «Муто Хитаку» капитана Муто Нобуёси124 с задачей «вести тщательную разведку и регулярно информировать о перебросках войск, военных материалов, ресурсов с побережья Черного моря на Дальний Восток, пропускной способности [коммуникаций], военной обстановке в данном районе [Черного моря] и в Центральной Азии, а также об отношениях России с Турцией и странами Балканского полуострова»125.
Однако главным следствием ихэтуаньских событий стало существенное укрепление разведывательной сети Генерального штаба в Корее и Китае, тесно соприкасавшейся с расположенными там российскими военными объектами: в 1901–1902 гг. в корейском Масане, где Россия с марта 1900 г. начала создавать пункт базирования флота, и китайском Инкоу были развернуты две легальные резидентуры во главе с капитанами Эги Акио и Нимпэ Сэндзюн, а в уже действовавшие организации в Китае отправились два офицера со специальными задачами по ведению агентурной разведки в Маньчжурии – майор Кадзикава Дзютаро в аппарат военного атташе в Пекине и майор Татибана Коитиро в Баодине в аппарат военного советника при наместнике провинции Чжили Юань Шикае126.
В связи с фактической оккупацией Россией Маньчжурии в результате подавления восстания ихэтуаней и ее усиленным экономическим проникновением в Корею, начальник Генерального штаба маршал Ояма Ивао реорганизовал 14 февраля 1902 г. аппарат 1-го управления в три отделения для концентрации усилий по сбору и анализу информации о нашей стране:
отделение «Ко» – изучало дислокацию всей русской армии, наличие в Приамурском военном округе и Маньчжурии тяжелой артиллерии, запасов продовольствия и боеприпасов, организацию русской армии в Сибири, готовило карты с дислокацией войск в Приамурском, Сибирском военных округах, Маньчжурии, схемы транспортных коммуникаций в Маньчжурии и Южно-Уссурийском крае, чертежи крепостей Владивостока и Порт-Артура;
отделение «Оцу» – изучало пропускную способность Транссиба и КВЖД, судоходных путей по рекам Амур, Сунгари и Уссури, состояние пароходного флота России, портов и гаваней Уссурийского края и Ляодунского полуострова, русского вооружения, деятельность органов военного управления и оперативное искусство, биографии старших офицеров русской армии, офицерские резервы в Сибири, вело учет переводчиков русского языка, собирало информацию об армиях Швеции, Норвегии, Дании, Бельгии, Швейцарии, стран Балканского полуострова, готовило схемы железнодорожного и водного сообщения в Восточной Сибири и Маньчжурии, карты Уссурийского края и Маньчжурии;
отделение «Хэй» – изучало органы власти, состояние природных ресурсов, транспортного сообщения, связи, финансов и армии Кореи, ее отношений с великими державами, организацию русского управления портом Масаи, деятельность организаций Германии и Франции на Дальнем Востоке, состояние армий Германии, Франции и Австро-Венгрии, действия русских войск во время Боксерского восстания (в том числе мобилизацию войск в Сибири, численность и темпы переброски русской армии наземным и морским путями из европейской части на Дальний Восток, ход боевых действий, запасы продовольствия и материальных ресурсов в Северном Китае и Маньчжурии)127.
Кроме того, для комплексного анализа собранных сведений приказом начальника Генштаба от 18 декабря 1902 г. был образован Комитет по сбору и оценке разведывательной информации во главе с генерал-майором Фукусима Ясумаса и его заместителем полковником Мацукава Тоситанэ, который обрабатывал большой объем данных от военных атташе и резидентов в Корее, Китае, России и Западной Европе и направлял разведсводки руководству Генштаба128. Анализ документов комитета свидетельствует, что к началу 1903 г. японская информация о русской армии отличалась высокой степенью достоверности: на 1 февраля военная разведка установила дислокацию всех 29 армейских, 2 кавалерийских корпусов, 52 стрелковых, пехотных, 24 кавалерийских дивизий, 154 стрелковых, пехотных, 64 артиллерийских бригад, не выявив только 1 кавалерийскую бригаду129.