Указом от 4 апреля 1800 г., данным на имя Санкт-Петербургского архиепископа Амвросия, было создано особое Управление военным духовенством, и военное духовенство отделялось от епархиального. Должность обер-полевого священника сделана постоянной, полковые священники подчинялись ему в административном и судебном отношениях. Первый обер-священник, протоиерей П. Я. Озерцковский (1800–1807)[498]
, получил право непосредственного сношения помимо Синода с епархиальными архиереями, а также право личного доклада царю. С 22 апреля 1800 г. в ведение оберсвященника перешли также и гвардейские священники.С воцарением Александра I происходит дальнейшее усложнение и развитие структуры военного духовенства. В 1807 г. появляются дивизионные благочинные, а в 1812 г. – корпусные священники (с 1821 г. – корпусные благочинные). 27 января 1812 г. в соответствии с утвержденным «Учреждением о большой действующей армии» в составе Главного штаба появилась должность полевого обер-священника, который стал промежуточным звеном управления военным духовенством между полевым обер-сященником армии и флота и благочинными дивизионными и корпусными. 12 января 1815 г. в связи с разделением военного ведомства на Военное министерство и Главный штаб в состав последнего введена новая должность обер-священника гвардии и гренадеров, с подчинением ему всех священников, входивших в состав Гвардейского корпуса. Этот оберсвященник назначался по непосредственному усмотрению императора, а обер-священник армии и флотов – из кандидатов Святейшего Cинода. С 1830 г. эта должность называлась обер-священник Главного штаба и Отдельного Гвардейского корпуса, а с 1844 г. – обер-священник Гвардейского и Гренадерского корпуса. В 1840 г. учреждается должность обер-священника в отдельном Кавказском корпусе, с подчинением священнику армии и флота[499]
.В 1853 г. обер-священникам было предоставлено право назначать и увольнять священников и церковнослужителей военного ведомства без предварительного разрешения Синода, а также была дана известная дисциплинарная власть над военными священниками. В военное время в ведении обер-священника оказывалось «духовенство постоянных и временных госпиталей, находившихся в губернии и области, объявленной на военном положении <…> а также духовенство крепостей и других военных церквей тех мест, где находилась Главная квартира при движении армии»[500]
. Расширялось и ведомство обер-священников путем присоединения к военному ведомству неподвижных церквей, прежде состоявших в ведении епархиального духовенства.В 1858 г. обер-священники переименованы в главные священники[501]
. Тогда же учреждена должность обер-священника Кавказской армии[502].Следующий этап преобразований приходится на 1880-е гг. В 1883 г. должности главных священников армии и флота, гвардии и гренадер были объединены, а управление всем военным духовенством сосредоточено в ведении главного священника армии и флота.
В 1884 г. учреждается особая комиссия из представителей духовного и военного ведомства под председательством великого князя Владимира Александровича для разработки нового положения и решения вопроса об управлении военным духовенством.