Обнаружились и курьезные расхождения: например, Джалилов требовал уравнять с нами в правах члена своей делегации Низами Бахманова, как представителя азербайджанской общины Карабаха. Бахманов действительно был карабахцем, но он не представлял ни парламентскую, ни какую-то иную структуру. Правда, в очень короткий период – всего несколько недель – он занимал пост мэра города Шуши, как раз накануне ее штурма, и эта должность оставалась высшей ступенью в его политической карьере.
Двое суток шла интенсивная совместная работа по выработке документа, который согласились бы подписать все, и к концу дня 5 мая, после изматывающих споров, все же удалось его подготовить. Бишкекский протокол, в котором содержался призыв к прекращению огня, подписали руководители Армении, НКР, посредники, но… неожиданно отказался подписать Джалилов. Свой отказ он объяснял весьма туманно: мол, не дали право подписи Низами Бахманову и вообще в целом итоговый документ не отвечает интересам Азербайджана. И это притом, что все два дня стороны только и занимались поиском взаимоприемлемого варианта соглашения и на словах Джалилов соглашался с получившимся текстом! Позднее выяснилась истинная причина этого отказа: оказывается, отправляя его на встречу, Алиев заранее запретил ему подписывать там какие бы то ни было документы без предварительного согласования с ним.
Завершилась встреча в Бишкеке тем, что все стороны, подписавшие протокол, согласились оставить Азербайджану право поставить свою подпись позднее, если он этого захочет. И действительно, через несколько дней, 8 мая, благодаря Казимирову, который прилетел из Бишкека прямо в Баку с этим документом, его подписал председатель Милли Меджлиса Азербайджана Расул Гулиев. Первый шаг – закрепление на бумаге намерения сторон остановить военные действия – был сделан.
В полночь 9 мая Карабах объявил о добровольном прекращении огня в одностороннем порядке. В ответ Азербайджан сделал аналогичное заявление. 9 мая при участии посредников началась подготовка к документальному оформлению прекращения огня. Договорились, что соглашение будут подписывать все высшие военачальники: со стороны Армении и Азербайджана – министры обороны, а от нас – главнокомандующий Армией обороны Нагорно-Карабахской Республики. Азербайджан выдвинул очередное условие: категорический отказ от совместной встречи с представителем нашей стороны для подписания соглашения. Решили действовать через посредников. Они подготовили три одинаковых документа и разослали их всем трем сторонам, чтобы каждая сторона подписала свой отдельный экземпляр. 9 мая подписал Мамедов, 10 мая – Серж Саргсян, 12 мая Самвел Бабаян подписал его от имени НКР. Эти три листка с одиночными подписями и стали соглашением о бессрочном прекращении огня.
В тексте соглашения содержалось обращение к Грачеву, министру обороны России, с просьбой провести совещание в Москве с участием военачальников всех трех сторон и согласовать технические детали: договориться о механизме прекращения огня, поскольку сам документ ни словом не упоминал о том, как будет происходить развод вооруженных сил конфликтующих сторон от линии соприкосновения, как будет создана зона безопасности. Отсутствовало решение о размещении в ней миротворческих сил или наблюдателей, не оговаривалось, какие меры контроля над ситуацией будут использоваться. Такая встреча по приглашению П.С. Грачева состоялась 16–17 мая 1994 года в Москве, но она ничего не прибавила к решению военно-технических вопросов, от которых по-прежнему уходил Азербайджан.
Подписание Бишкекского соглашения оказалось очень своевременным и для нас, и для азербайджанцев. Обе стороны были истощены длительными непрекращающимися боями. Мы поставленную перед собой задачу выполнили: вышли на ту линию соприкосновения, которую планировали. Провал же зимнего наступления Азербайджана и реальная угроза потери Тер-Тера (Мирбашир) сделали Баку гораздо более сговорчивым. Если бы мы заняли Тер-Тер, открылась бы возможность наступления на Евлах с двух направлений, с последующим выходом на Куру, и тогда мы могли отрезать северо-западную часть Азербайджана от остальной территории. В Азербайджане опасались, что мы пойдем дальше, а мы понимали, что любой наш выход дальше, во-первых, потребует новых ресурсов, которыми мы не располагали, а во-вторых, растянет линию фронта на восток, создав нам проблему ее удержания в будущем. Таким образом, каждая из сторон имела веские причины согласиться на долгосрочное прекращение огня.