После девяти месяцев совместной работы Альфред и Генри решили, что они смогут сделать больше, если каждый будет работать самостоятельно. Альфред отправился исследовать окрестности реки Риу-Негру, крупнейшего левого притока Амазонки, добравшись до южной точки маршрута Гумбольдта в Венесуэле, а Генри должен был исследовать местность в районе реки Солимойнс. Альфред продолжал собирать образцы флоры и фауны и начал составлять карту этой малоизученной территории бассейна Амазонки, здесь ему как нельзя кстати пригодились навыки работы землемера. Однажды, поднимаясь по реке на каноэ, он встретил местных жителей из амазонских племен. От них он услышал истории и легенды о ягуарах, пумах, свирепых диких кабанах, диких людях с хвостами и ужасном
Рис. 29.
В 1849 году Альфред приглашает младшего брата Герберта присоединиться к экспедиции. Герберт приезжает в компании еще с одним молодым путешественником, ботаником Ричардом Спрусом, и в течение следующих двух лет они втроем занимаются собиранием экспонатов разнообразной флоры и фауны в джунглях Амазонки. К несчастью, в 1851 году Герберт умирает от желтой лихорадки в Паре, а Альфред переносит несколько приступов малярии. Ему удается справиться с болезнью, однако он чувствует себя разбитым и подавленным. Он решает вернуться в Англию, а Генри Бейтс останется на Амазонке еще на шесть лет.
В июле 1852 года Альфред снова возвращается в Пару, чтобы отправить последнюю партию образцов. Ящики с упакованными экспонатами вместе с живой коллекцией, состоявшей из птиц, обезьян и дикой собаки, погрузили на корабль «Елена», направлявшийся в Англию. Через несколько дней, когда корабль уже был в открытом море, Альфред сидел после завтрака в своей каюте, как вдруг кто-то постучался в дверь. Это был капитан, сообщивший ему о том, что на судне начался пожар. Альфреду и членам команды пришлось срочно покинуть корабль и пересесть в спасательные шлюпки; из всей коллекции ему удалось захватить с собой только дневник и несколько карандашных зарисовок рыб Амазонки. Сидя в шлюпке, он с ужасом видел, как огонь пожирает корабль, а вместе с ним и его драгоценные экспонаты. Вся живая коллекция погибла, сгорев или уйдя на дно вместе с затонувшим судном. Уцелел лишь попугай, который упал в море, и его подобрали матросы.
Спустя десять дней дрейфования в открытом океане лицо и руки Альфреда покрылись волдырями от солнечных ожогов, а запасы пищи и воды были на исходе (судьба спасенного попугая неизвестна). К счастью, их заметили и взяли на борт брига «Джордесон», направлявшегося в Англию с грузом леса. Тяжело нагруженный бриг двигался медленно, со скоростью всего лишь два-три узла, и путешествие затянулось, однако через 80 долгих дней плавания Альфред сошел на берег в прибрежном городе Диле в графстве Кент и с удовольствием отобедал с капитанами обоих судов. Еще больше его обрадовала новость о том, что Стивенс заранее застраховал груз на сумму 200 фунтов. Стивенс оказался надежным агентом: ему удалось напечатать несколько научных статей на основании писем Альфреда с наблюдениями, а также организовать выставку и продать большую часть доставленных ранее экспонатов. Итак, вернувшись в Лондон, Альфред с удивлением и радостью обнаружил, что его знают и уважают в кругах коллекционеров-натуралистов как человека с крепкой репутацией.
Получив 200 фунтов, Альфред, не теряя времени, стал готовиться к новой экспедиции, на этот раз он решил двинуться на восток. В марте 1854 года он отправляется исследовать Малайский архипелаг и в апреле сходит на берег в Сингапуре. Через четыре года он отправит Дарвину уже известное нам письмо.
Первые три месяца Альфред проводит на острове Сингапур, собирая образцы флоры и фауны, а 1 ноября 1854 года прибывает в порт Кучунг в провинции Саравак на Борнео и организует там базовый лагерь. Он нанимает в помощники пятнадцатилетнего малайского мальчика Али, который готовит пищу и помогает Альфреду в изучении малайского языка. К тому же Али оказался опытным охотником и умел делать чучела птиц, поэтому Альфред не расстается с ним все восемь лет своего путешествия по островам Малайского архипелага.