Лишь несколько лет спустя почерпнутые в процессе проводимых им экспериментов наблюдения нашли свое отражение в его докторской диссертации «О психологии и патологии так называемых оккультных феноменов», которая была им представлена к защите в 1902 году и в которой описываемый им медиум воспринимался в качестве истерического типа.
В своей диссертации Юнг изложил случай с Хелен под видом пациентки С.В. И хотя он специально оговорил, что не был врачом этой пациентки, а только наблюдал этот случай, тем не менее, в диссертации С.В. фигурировала именно в качестве пациентки. При этом он написал о том, что пациентке было 15 с половиной лет, а наблюдаемый им случай имел место в 1899 и 1900 годах.
Позднее Юнг признал то обстоятельство, что проводимые им эксперименты с Хелен послужили отправной точкой для выдвижения идей, так или иначе связанных с аналитической психологией. По его собственному выражению, подобно тому, как для Фрейда решающим был случай с пациенткой Брейера (случай Анны О.), так и в основе его взглядов лежит одно имевшее определяющее значение переживание, когда, будучи студентом, он длительное время наблюдал случай сомнамбулизма у одной молодой девушки, который стал темой его докторской диссертации.
«Знатоку моей научной продукции будет небезынтересно сравнить эту написанную более 40 лет назад работу с моими более поздними взглядами».
Что касается его кузины Хелен, то она умерла в 1911 году. Но не в двадцать шесть лет, как указано в книге Юнга «Воспоминания, сновидения, размышления», а не дожив несколько дней до своего тридцатилетия.
Зофингия
В мае 1985 года Юнг стал членом Базельской секции швейцарского студенческого общества Зофингии. Того студенческого братства, в которое ранее входил его отец.
В то время Базельская секция Зофингии состояла приблизительно из 120 членов, студентов медицинского, теологического, философского и юридического факультетов. На еженедельно проводившихся собраниях студенты обсуждали проблемы, вызывавшие у них наибольший интерес.
Юнг не проявлял интереса ни к различного рода пирушкам, ни к публичным балам, устраиваемым членами Зофингии. Его интересовали главным образом те дискуссии, которые велись в рамках студенческого братства.
Поначалу Юнг не принимал активного участия в дискуссиях, но внимательно выслушивал все те аргументы, которые использовались студентами, отстаивающими свои позиции. Во всяком случае, на протяжении трех учебных семестров он ни разу не выступал публично.
Только в четвертом учебном семестре в ноябре 1896 года Юнг решился выступить с докладом «О границах точных наук». В этом докладе он критически отнесся к науке, основанной на материалистическом фундаменте, считая, что возможности такой науки для познания довольно ограничены и касаются главным образом специальных предметов. Одновременно он высказался в пользу изучения спиритизма и гипноза.
Прочитанный Юнгом доклад вызвал одобрение среди многих студентов. Более того, руководство общества посчитало целесообразным опубликовать этот доклад в журнале, однако по неизвестным причинам он так и не был опубликован.
В следующем учебном семестре Юнг выступил с докладом «Некоторые мысли о психологии», в котором высказал соображения по поводу необходимости привлечения внимания к метафизике.
«Когда нормальный человек воображает, что ничего метафизического не происходит в его жизни, то он упускает из виду одно метафизическое событие: свою смерть».
В этом же докладе Юнг высказал мысль, в соответствии с которой одна из важных задач психологии заключается в доказательстве существования души.
Выступления с докладами и активное участие в дискуссиях выдвинули Юнга в лидеры, в результате чего он был избран президентом Базельского отделения Зофингии.
В начале 1899 года Юнг сделал доклад о теологии Альбрехта Ричля, которая в то время была на устах многих студентов, разделявших его теорию об историческом эффекте подвижничества Христа. В этом докладе он представил данную теорию как бессмысленную и подчеркнул необходимость учета мистических элементов в религии.
Юнг активно участвовал в дискуссиях по проблемам сна, теологии и религии. В ходе этих дискуссий им было подчеркнуто, в частности, что в сновидениях находят отражения наши желания, понятие «доброго Бога» содержит в себе внутреннее противоречие, религиозные переживания сопровождаются нередко эротическими проявлениями, между религией и сексуальным инстинктом существует тесная связь.
За время обучения в университете Юнг сделал пять докладов в обществе Зофингия. В этих докладах он не раз касался проблематики паранормальных явлений. В частности, он неоднократно ссылался на работу И. Канта «Грезы духовидца»(1766), в которой был осуществлен разбор пророческого опыта шведского ясновидца Эммануэля Сведеборга.
В эти же годы Юнг проявлял особый интерес к идеям таких авторов, как Франц Месмер, Юстин Кернер, Артур Шопенгауэр, под влиянием которых формировалось его мироощущение. Впоследствии он отмечал то обстоятельство, что студенческие годы были прекрасным временем для него.