Транспортировка моджахедам оружия и прочих припасов из Пакистана в Афганистане была оставлена на усмотрение частного сектора. Финансирование перевозок поступало в основном от неправительственных арабских доноров. На территориях племен (ФАТА) эти средства распределяли кувейтское и саудовское отделения Красного Полумесяца. Они предоставляли полное финансирование плюс 10 % на непредвиденные расходы для исламистов и только 10 % от необходимого для так называемых «националистических» («ватани») организаций. Исламистские партии доминировали на севере Афганистана отчасти потому, что только они могли позволить себе оплатить перевозку грузов через Гиндукуш.
Для контроля примерно над тремя миллионами беженцев Пакистан также использовал партийные структуры. Чтобы получить право на получение помощи, каждая семья беженцев должна была зарегистрироваться в одной из семи признанных организаций. Таким образом, эти организации стали партнерами Комиссара по делам беженцев Пакистана, а также ISI. Те партии, у которых был доступ к большему количеству ресурсов, могли привлечь больше регистраций.
Привлечение в Афганистан и Пакистан арабских боевиков и организаций по оказанию помощи было частью вклада Саудовской Аравии в пакистано-саудовскую операцию США по поддержке моджахедов. Арабские боевики практически не внесли военного вклада в борьбу, но они играли финансовую и политическую роль.
Частные взносы арабских доноров из стран Персидского залива позволили ликвидировать пробелы в финансировании. Арабские моджахеды также помогли продвинуть публично озвученную дипломатическую цель США – превратить Афганистан в Палестину для Советского Союза. Хотя у США не было прямых контактов с арабскими моджахедами в Пакистане, они поощряли их лидеров совершать поездки, в том числе в США, с целью сбора средств и проповедования обязанности джихада (борьбы с врагами ислама), направленного против Советского Союза.
Некоторые добровольцы приезжали по собственной инициативе. Саудовские турагенты даже организовывали джихад-паке-ты, приуроченные к школьным каникулам. Однако очень скоро совместными усилиями Саудовской Аравии, которой тогда правил король Фахд, и «Братьев-мусульман» (суннитской исламистской организации) была устроена организованная вербовка. Важной фигурой в этом движении был Абдул-Азиз ибн Баз, Великий муфтий Саудовской Аравии и глава Исламской всемирной лиги (Рабита), которая продвигала и проповедовала по всему миру салафитский ислам.
Главным идеологом и теоретиком арабских моджахедов был шейх Абдулла Аззам, исламский ученый, родившийся в палестинской деревне недалеко от города Дженина. Он покинул Западный берег реки Иордан, когда Израиль оккупировал его в 1967 г. Как и многие другие беженцы 1967 г., он переехал в Иорданию, где присоединился к группе палестинских фидаинов. Через несколько лет он пришел к выводу, что светская ориентация палестинского руководства делает невозможным ведение джихада, и получил должность преподавателя в Джидде, где одним из его учеников был Усама бен Ладен.
Когда в декабре 1979 г. Советский Союз вторгся в Афганистан, Аззам опубликовал фетву (обязательное для мусульман решение исламского религиозного лидера) под названием «Защита мусульманских земель – первая обязанность после веры», в которой обязанность вести джихад в Афганистане приравнивалась к обязанности вести соответствующую борьбу в Палестине. Абдул-Азиз ибн Баз поддержал эту фетву. Поскольку широкая возможность вести джихад имелась именно в Афганистане, он выступил за эмиграцию в эту страну с данной целью. Он убедил Усаму бен Ладена отправиться туда в 1980 г. и вскоре последовал за ним. В пакистанском Пешаваре он основал офис «Мактаб аль-Хидамат», центр, осуществлявший набор арабских моджахедов и предоставлявший им необходимые ресурсы. Он также координировал деятельность «ансаров», сторонников джихада, в число которых входили представители исламских организаций, оказывающих помощь беженцам.