Такая война в воздухе продолжалась до 13 (14 по Токийскому времени) сентября 1942 г., когда американцы нанесли удар по Кыске крупной группой в 13 В-24, 1 В-17, 14 Р- 38 и 14 Р-39. При этом истребители должны были не только защищать бомбардировщики от вражеских истребителей, но и проводить штурмовку наземных объектов и кораблей в гавани Кыски. Такая работа облегчалась тем фактором, что после ввода в строй аэродрома на острове Адак до Кыски могли «дотягиваться» не только Р-38, но и Р-39 с меньшим радиусом действия, но мощной 37-мм пушкой. Хотя результаты атаки были не такими радужными, как их описали американцы, им было чем гордиться: их действия привели к гибели мобилизованного флотского транспорта «Нодзима-мару» водоизмещением в 7190 грт. Это было самое большое японское судно, потопленное у Алеутских островов за всю войну. В течение 20 минут судно лишилось хода вследствие близкого разрыва бомбы и затопления машинного отделения, было проштурмовано истребителями (при этом погиб командир транспорта капитан 1-го ранга Итагаки Коити) и позднее поражено бомбой, проделавшей немалую дыру в корпусе. Усилиями экипажа корабль удалось удержать на плаву, но вернуть кораблю ход так и не удалось. 1 октября в «Нодзима-мару» попала ещё одна американская бомба, после чего корабль посадили на мель у берега Кыски. Так как транспорт уже не подлежал ремонту, 13 октября 1942 г. он был оставлен экипажем. Впрочем, это не помешало американским лётчикам «уничтожить» его ещё раз 20 апреля 1943 г.
Кроме «Нодзима-мару» американцы атаковали и другие корабли и суда в гавани Кыски, а также различные береговые объекты, в том числе зенитные батареи и базу сверхмалых подводных лодок. Также был повреждён радар и различные строения. На берегу погибло всего 10 человек, но было много раненых.
Пилоты истребителей 5-й авиагруппы заявили о 5 сбитых «точно» и ещё 1 «вероятно», причём сразу о 4 машинах заявил старшина 2-й статьи Сасаки Гиити. На самом же деле ни истребители, ни зенитчики не смогли сбить ни одного вражеского самолёта: оба потерянных в этом бою Р-38 погибли в столкновении, гоняясь за одним из японских истребителей. А вот потери 5-й авиагруппы от действий американцев были весьма реальными и составляли 3 гидроистребителя и 2 пилота - в строю авиагруппы остался только один истребитель.
По счастью, уже 24 сентября к Кыске пришёл мобилизованный гидроавианосец «Кимикава-мару», который доставил 6 новых A6M2-N и 2 Е13А. Впрочем, за следующие 10 дней все истребители и 4 пилота авиагруппы были потеряны в 9 воздушных боях против превосходящего противника. Пилоты 6-й АГ заявили о 3 достоверных и 2 вероятных победах плюс 4 повреждённых неприятельских самолёта, хотя, по американским данным, можно подтвердить только сбитие 1 Р-39.
А тем временем гидросамолёты-разведчики Е13А из состава авиагруппы всё продолжали и продолжали свои полёты на разведку и патрулирование, периодически обеспечивая командование важной информацией о неприятеле. Скорее всего, именно они в начале октября обнаружили американский аэродром на острове Адак, который дважды (2 и 3 октября) атаковали самолёты 5-й АГ.