К началу Великой Отечественной войны на территории Беларуси в тяжелом состоянии находились все конфессии, в том числе и Православная церковь. В результате атеистического наступления на восточных территориях была разрушена православная приходская жизнь, закрыты храмы и монастыри, практически подвергалось репрессиям все духовенство, многих священнослужителей постигла мученическая кончина. В связи с этими причинами в восточной части республики Патриаршая церковь Московского Патриархата почти прекратила свое существование еще к 1939 г. Существовали 2 катакомбные общины в Могилеве и Гомеле. В западных регионах, которые до сентября 1939 г. находились в составе Польши, власти не успели приостановить религиозную жизнь. Накануне войны в Западной Беларуси действовало около 800 храмов и 5 монастырей, объединенных в 3 епархии: Виленскую, Гродненскую и Полесскую, до захвата Польши принадлежавших Польской православной церкви.
17 октября 1939 г. управление новоприсоединенными епархиями было поручено от имени Московской Патриархии архиепископу Пантелеймону (Рожновскому), которому было дано звание Экзарха западных областей Белоруссии и Украины. Но каноническая власть митрополита Сергия (Страгородского) как главы Московской Патриархии была признана только Острожским епископом Симоном (Ивановским); архиепископ Пинский и Полесский Александр (Иноземцев) и епископ Волынский и Кременецкий Алексий (Громадский) учредили Синод, который не был признан Московской Патриархией.
В июле 1940 г. из Москвы в Луцк прибыл митрополит Николай Ярушевич, назначенный митрополитом Сергием (Страгородским) на кафедру Волынской епархии со званием Экзарха Западных Украины и Беларуси. Архиепископ Пантелеймон (Рожновский), ранее занимавший пост, был освобожден от обязанностей экзарха. По просьбе последнего 30 марта 1941 г. в Москве был рукоположен в епископа Брестского, викария Гродненско-Вилейской епархии архимандрит Венедикт (Бобковский), настоятель Жировичского монастыря. Епископ Венедикт остался жить вместе с архиепископом Пантелеймоном в Жировичском монастыре.
Архиереями непосредственно перед войной были: митрополит Николай (Ярушевич) с титулом Экзарха Западной Украины и Белоруссии, убывший вместе с отступающими советскими войсками в июле 1941 г.; архиепископ Пантелеймон (Рожновский), возглавлявший новосозданную Гродненско-Вилейскую епархию и снова назначенный экзархом после отъезда Николая Ярушевича; епископ Венедикт (Бобковский), викарный епископ Брестской епархии, бывший с 1937 г. управляющим Жировичским монастырем; архимандрит Почаевской лавры Вениамин (Новицкий), епископ Полесский.
Религиозная жизнь в период фашистской оккупации на территории Беларуси активизировалась. Гитлеровцы пытались таким образом завоевать симпатии населения. В то же время следует отметить, что все религиозные организации действовали в полной зависимости от оккупационных властей и должны были решать навязываемые им задачи. Нацисты приступили к осуществлению своей политики в отношении конфессий.
Христианство с его универсализмом и общечеловеческими и моральными ценностями противоречило идеологии нацизма. Отвергая христианское мировоззрение, обрядность, традиции, нацисты предлагали создать свой политизированный вариант церкви, являющейся проводником национал-социализма. Даже католицизм в Германии не считался немецкой конфессией, особая роль в обновлении нации отводилась протестантизму. Исходя из общей политики, на оккупированной территории вырабатывались особенности отношений рейха к православию, католицизму, протестантизму. Общим являлось отсутствие запрета на возрождение церковной жизни. Завуалировав истинное отношение к религии, нацисты тем самым решали задачу привлечения на свою сторону широких слоев верующего населения, повышения эффективности антисоветской пропаганды.
Началось возрождение церковной жизни и в восточной Беларуси: открывались новые храмы, рукополагались священники, массово проводились таинства. Оккупационные власти содействовали возрождению церкви в расчете на завоевание симпатий и среди православного населения.
В Генеральном комиссариате «Беларусь» функционировало специальное подразделение «Конфессиональные общества», входившее во 2-й отдел «Политика», являвшийся его главной идеологической структурой. Весь оккупационный период его возглавлял Леопольд Юрда. Здесь решались все вопросы религиозной жизни: начиная от регистрации священнослужителей, их перемещения на новые приходы и должности, открытия храмов, заканчивая формированием автокефальной православной церкви.
Возрождая православную жизнь, как нацистский режим, так и белорусская коллаборация на практике стремились осуществить идею национальной самостоятельной церкви. Она виделась им белорусскоязычной как в проведении проповедей, так и в делопроизводстве.