7 августа Государственная комиссия по расследованию катастрофы сообщила, что группа международных экспертов завершила первую фазу поисков обломков самолета и тел погибших пассажиров в связи с угрозой жизни членов группы, работавших на месте катастрофы. По информации комиссии, «неисследованными остаются менее трех территориальных зон, где находятся обломки». До принятия решения о продлении поисков большая часть экспертов покинет Украину, за исключением небольшой группы для осуществления связи и координации.
По состоянию на 10 октября 2014 г. были опознаны 272 погибших.
Власти ДНР через несколько часов после катастрофы заявляли, что бортовые самописцы малайзийского «Боинга» будут переданы на экспертизу в Россию, в Межгосударственный авиационный комитет. Министр иностранных дел России Сергей Лавров 18 июля заявил, однако, что Россия не будет забирать «черные ящики»: «Мы не собираемся забирать “черные ящики”. Мы не собираемся нарушать нормы для таких случаев в международном сообществе… Это дело тех государств, которые имеют наиболее прямое отношение к той трагедии, чьи граждане были на борту… Это нужно сделать, чтобы ни у кого не оставалось сомнений в неискренности и готовности провести полноценное расследование».
19 июля министр транспорта Малайзии Наджиб Тун Разак потребовал предоставить «черные ящики» потерпевшего крушение самолета. По его словам, согласно международному праву, владелец самолета, то есть в данном случае Малайзия, имеет полное право на то, чтобы ему отдали бортовые самописцы. Ранее в Киеве заявили, что, «согласно всем нормам международного права, эти бортовые самописцы должны находиться на территории государства, где произошел этот инцидент, то есть на территории Украины». «Соответственно, перемещение их за пределы Украины является неправомерным», – сказал директор департамента консульской службы МИД страны Андрей Сыбига.
20 июля агентство Интерфакс сообщило, что «черные ящики» действительно обнаружены и доставлены в Донецк. При этом премьер-министр ДНР Александр Бородай заявил, что ДНР не отдаст самописцы властям Украины, но готова передать их международным экспертам: «В районе крушения обнаружены технические детали лайнера, похожие на чёрные ящики, они находятся в Донецке, в Доме правительства ДНР под моим личным контролем. Они будут вручены международным экспертам в случае их приезда».
Поздно ночью с 21 на 22 июля глава правительства ДНР Александр Бородай в присутствии наблюдателей ОБСЕ и журналистов передал «черные ящики» представителям Малайзии. Факт передачи был зафиксирован в специальном протоколе, подписанном двумя сторонами. Представитель Малайзии, член ее Совета национальной безопасности полковник Мохамед Сакри, поблагодарив Бородая, сказал: «Я вижу, что “черные ящики” в нетронутом состоянии, хотя и немного поврежденные». Малайзийские представители в свою очередь передали самописцы экспертам из Нидерландов.
22 июля министр иностранных дел Нидерландов Франс Тиммерманс, выступая на заседании Совета Безопасности ООН, заявил, что Нидерланды согласились взять на себя ведущую роль в расследовании обстоятельств авиакатастрофы в тесном сотрудничестве с соответствующими странами.
24 июля британские официальные лица заявили, что не станут предавать публичной огласке данные, полученные в результате расшифровки бортовых самописцев, предоставив это сделать нидерландским властям.
Спикер Генпрокуратуры Украины Юрий Бойченко заявил, что Украина, Нидерланды, Бельгия и Австралия 8 августа подписали соглашение, согласно которому разглашение информации о расследовании катастрофы «Боинга-777» возможно только при согласии всех сторон соглашения. 19 ноября правительство Нидерландов отказалось отвечать на запросы журнала Elsevier о тайном пакте по контролю за расследованием, заявив, что «риск ущерба отношениям Нидерландов с другими странами и международными организациями перевешивает пользу от раскрытия информации».
12 сентября голландский главный прокурор по делу «Боинга» Фред Вестербеке выступил с заявлением. Он сообщил, что наиболее вероятной версией катастрофы является сбивание самолета с земли. В октябре 2014 г. он уточнил, что хотя эта версия является основной, рассматриваются и иные возможные причины падения самолета, в частности, атака с другого самолета. Также он сообщил, что версии о теракте на борту и об аварии по техническим причинам были отвергнуты в ходе предварительного расследования.
«Еще 21 июля президент Украины Петр Порошенко приказал военным прекратить боевые действия в радиусе 40 километров от места крушения малайзийского “Боинга”. Как заявил глава государства журналистам, военнослужащие отныне не имеют права “проводить операции и не должны открывать огонь” в этой зоне.
Несмотря на это громкое заявление, украинская армия продолжала боевые операции в указанном районе. Официальный Киев, правда, пытался доказывать, что перемирие в районе катастрофы соблюдает, а обстрелы – дело рук ополченцев.