Как бы сейчас сказали, в области здравоохранения император также предпринял ряд шагов. Так, 3 декабря 1801 г. его указом запрещалось откармливать скот мясом «палого скота», а 24 декабря Синод запретил переносить покойников, захороненных «несколько времени назад». 25 декабря император выделил на содержание придворной аптеки 30 тысяч рублей в год. Для усовершенствования во врачебной науке лекарей 15 января 1802 г. разрешалось отправлять за границу. Прививать «коровью оспу» отправили 9 апреля 1802 г. во внутренние губернии специального врача. Карантинная застава 18 мая 1802 г. была учреждена у Дубоссар Новороссийской губернии. Ввиду недостатка медиков именным от 17 июля и синодскими указами от 24 июля и 21 августа 1802 г. в семинариях вводилось обучение «первых начал» медицинской науки, а отдельных семинаристов отправляли в Медико-хирургическую академию. Общую больницу в Кронштадте решено было открыть 18 августа 1802 г.[116]