Хотя АК была распущена своим командующим в январе 1945 года, после установления советского контроля над Польшей она подверглась жестоким нападкам, а ее солдаты и офицеры – преследованиям (несколько десятков тысяч из них были вывезены в Советский Союз и там интернированы в лагерях ГУПВИ, а некоторые арестованы и осуждены). Часть бойцов подполья хотела продолжать борьбу против, как они считали, новых оккупантов и сотрудничавшей с ними власти. Именно в среде АК было создано объединение «Свобода и независимость», которое в первые послевоенные годы организовало политическое и вооруженное сопротивление. В подполье его конкурентами были организации националистической направленности: Национальное военное объединение и Национальные вооруженные силы. В значительной части страны существовали вооруженные отряды, совершавшие нападения на местные органы новой власти. В 1945–1947 годах госбезопасности и армии удалось подавить сопротивление подполья и арестовать его лидеров, которые в дальнейшем были приговорены к длительным срокам заключения, а некоторые казнены. Несмотря на объявленную властями в 1947 году амнистию, бойцы АК и вообще антинемецкого подполья времен оккупации составляли подавляющее большинство среди нескольких десятков тысяч политзаключенных. Они начали выходить из тюрем только в середине 1950‐х, когда наступила оттепель. В дальнейшем их личные судьбы складывались по-разному, но для властей они всегда оставались «подозрительными элементами».
Подпольная борьба в надежде на радикальное изменение геополитической ситуации была лишь одним из видов сопротивления. Помимо нее существовала также легальная оппозиция, главной силой которой была крестьянская партия Польске стронництво людове (ПСЛ) во главе с бывшим премьер-министром эмигрантского правительства Станиславом Миколайчиком. Миколайчик признал Ялтинские соглашения и хотел добиться выполнения одного из их пунктов – проведения в Польше свободных выборов. Он создал партию, которая в пиковый момент своего развития насчитывала 800 тысяч членов, и, невзирая на притеснения, пропагандистские атаки, репрессии и обман, пытался вести борьбу демократическим путем, используя механизм выборов. Несмотря на поддержку западных гарантов Ялтинских соглашений, он проиграл: подчиненные Сталину коммунистические власти не собирались выполнять принятые в Ялте обязательства. После того как в январе 1947 года выборы были фальсифицированы и в Сейм прошла лишь небольшая группа депутатов от ПСЛ, в октябре жестоко преследуемый Миколайчик бежал из Польши. Некоторые лидеры ПСЛ последовали его примеру, многие были арестованы, и партию возглавили люди, готовые к далекоидущим компромиссам с коммунистами.
Многие круги выражали протест против диктатуры и продемонстрировали волю к сопротивлению, но засилье коммунистов в органах исполнительной власти не позволило другим партиям перейти на легальное положение. Это не удалось ни национал-демократам, ни социал-демократам. Несколько месяцев, хотя и в крайне трудных условиях, действовали христианские демократы – Партия труда, однако в июле 1946 года, после того как власти не разрешили христианским демократам провести конгресс, председатель партии Кароль Попель приостановил ее деятельность. Подчиненная своей прокоммунистической фракции, партия просуществовала в виде небольшой группировки до 1950 года.
В первые послевоенные годы сопротивление коммунистическим властям принимало форму патриотических манифестаций, как, например, 3 мая 1946 года (в годовщину принятия Конституции 1791 года) в Кракове и других городах, иногда – забастовок; но чаще оно заключалось в культивировании искоренявшихся властями ценностей, в помощи преследуемым, в хранении предметов, связанных с национально-освободительными традициями, и в воспитании молодежи в этих традициях. Поэтому важным элементом сопротивления были молодежные подпольные организации, особенно в период, когда в Польше воцарился суровый сталинский режим.
Коммунисты правили в Польше с июля 1944 года, в первые годы сохраняя видимость ограниченного плюрализма. Формально правительства формировались по принципу коалиции – с социалистами, ПСЛ, демократами, – однако все эти партии (точнее, их остатки, сохранившиеся после эмиграций и репрессий) недвусмысленно и безусловно подчинялись коммунистической Польской рабочей партии (ППР). Именно она полностью контролировала аппарат госбезопасности, политический аппарат армии, репрессивный аппарат. Столь же крепко она держала в своих руках и пропагандистскую машину. Благодаря этому с помощью Москвы она могла расправляться как с подпольной, так и с легальной оппозицией, фальсифицировать результаты референдума (30 июля 1946 года) и первых выборов в Сейм в январе 1947 года. На следующем этапе, до декабря 1948 года, коммунисты лишили всякого значения другие легальные политические силы и подготовили – как и в других странах советского блока – «объединение рабочего движения», которое заключалось в том, что коммунистическая ППР поглотила Польскую социалистическую партию.