Прусское наследие Альбрехта Старого
, превратившего бывшие орденские земли в настоящий династический больверк с прекрасной организацией, унаследованной от старых орденских времен, хотя и находилось под ленным покровом польской короны, однако связывалось тесными узами родства с Бранденбургом. Согласно завещанию Альбрехта, в своей концепции всецело соответствовавшему династическим принципам первых курфюрстов, устанавливалось наследование по мужской и женской линии, но без права отчуждения родовых владений. Последнее обстоятельство побуждало наследников Альбрехта ориентироваться в брачной политике преимущественно на старших бранденбургских родственников. Тесные узы родства прусского Дома с Бранденбургом постепенно вели к прямому династическому альянсу двух ветвей. Еще в годы правления Иоахима II бранденбургскому курфюрсту удалось добиться от польского короля Сигизмунда Августа, на сестре которого он был женат, инвеституры на прусские лены. В 1591 г., еще будучи несовершеннолетним, младший сын курфюрста Иоганна Георга (1571–1598) Иоганн Сигизмунд был помолвлен на внучке Альбрехта Прусского Анне, отец которой Альбрехт Фридрих, страдавший слабоумием, оказался не способен к правлению. Видимость самостоятельности прусского герцогства еще поддерживалась опекунством маркграфа Георга Фридриха из франконского Дома Гогенцоллернов. После его смерти в 1603 г. управление Орденской Пруссией окончательно перешло к бранденбургским курфюрстам. Смерть же самого Альбрехта Фридриха в 1618 г. означала пресечение мужского колена ансбах-байройтского Дома в Пруссии, что позволило Иоганну Сигизмунду, ставшему курфюрстом в 1608 г., присоединить прусские владения Гогенцоллернов к курфюршеству Бранденбург.Одновременно перед Гогенцоллернами открылись блестящие перспективы на западе Империи. Женитьба Иоганна Сигизмунда на Анне Прусской, по линии своей матери бывшей в родстве с юлих-бергскими герцогами, позволила Гогенцоллернам принять участие в борьбе за наследство Клевского Дома
. После смерти последнего герцога Юлих-Берга Иоганна Вильгельма (1592–1609), умершего бездетным и имевшего лишь многочисленных сестер, бывших замужем за другими имперскими князьями, Бранденбург предъявил свои притязания на выморочный лен, ссылаясь на завещание отца, скончавшегося клевского герцога Вильгельма Богатого, согласно которому престол в случае бездетной смерти его сына должен был перейти к родственникам старшей его дочери. Немедленно начавшийся вслед за тем весьма драматичный и сопровождавшийся открытым военным противостоянием конфликт был разрешен в 1614 г. соглашением в Ксантене закреплявшим за Гогенцоллернами собственно герцогство Клеве, маркграфство Марк и Равенсберг. В итоге Бранденбург обзавелся стратегически важным вестфальско-рейнским плацдармом. Тем самым к началу Тридцатилетней войны Гогенцоллерны укрепились на востоке в Пруссии и на западе на берегах Рейна («бранденбургский орел расправляет крылья»). Вместе с тем были созданы благоприятные предпосылки к последующему территориальному росту в северной Германии.В южном и юго-восточном направлении Гогенцоллернам удалось окончательно поставить под свой контроль среднее течение Эльбы, где главным форпостом выступало архиепископство Магдебург
. После интронизации там в 1513 г. Альбрехта Бранденбургского, младшего сына курфюрста Иоганна Цицерона, архиепископство оказалось фактически семейным уделом бранденбургских курфюрстов. В свою очередь, переход в 1552 г. митры архиепископа к Сигизмунду Гогенцоллерну (1552–1566), симпатизировавшему протестантам, означало победу Реформации в архиепископских землях. В 1561 г. там была проведена инвентаризация монастырского имущества, что означало первый шаг к секуляризации этого духовного княжества. Последующие Гогенцоллерны управляли архиепископством практически на правах евангелических администраторов (Иоахим Фридрих, 1566–1598; Христиан Вильгельм, 1598–1628). Вместе с тем пришел конец и гегемонии Веттинов на берегах Эльбы, представлявших здесь свои династические интересы со времени позднего средневековья.