Для размещения всей экспедиции оказалось недостаточно одной гавани. Булонь вмещала в себя только от 1200 до 1300 судов, а их надлежало разместить около 2300. Если бы даже порт вместил все необходимое число, то слишком долго было бы выводить их в море одним фарватером. В случаях морской непогоды очень невыгодно иметь одно только место прибежища. В четырех лье ниже к югу текла речка Канш, устье которой составляло извилистую, занесенную песками бухту, по несчастью открытую для всех ветров, с рейдом, совсем не столь надежным, как булонский. Там располагалась рыбачья гавань Этапль. На той же реке Канш, на расстоянии одного лье от берега, находилось укрепленное местечко Монтрёй. Там трудно было выкопать бассейн, но удалось бы наколотить ряд свай для причала судов и на сваях настлать деревянные набережные. Гавань эта могла служить довольно безопасным пристанищем для трех или четырех сотен судов. Выходить из нее можно было с помощью почти тех же ветров, как из Булони. Расстояние до Булони, равнявшееся четырем или пяти лье, несколько затрудняло слаженность операций, но это была второстепенная трудность. А пристанище для четырехсот судов представлялось настолько важным, что им не стоило пренебрегать.
Первый консул установил тут лагерь для войск, соединенных между Компьеном и Амьеном, поручив начальство над ними генералу Нею, возвратившемуся из поездки в Швейцарию. Лагерь назывался Монтрёйским. Центр армии располагался в Булони, Этапльский лагерь находился слева от центра.
Несколько севернее Булони, не доезжая мыса Грине, имелись еще две бухты, образуемые двумя речками, русла которых также были занесены илом и песком, но вода во время прилива достигала в них шести или семи футов. Одна бухта отстояла на лье, другая — на два лье от Булони, кроме того, обе они лежали под одним ветром. Здесь можно было поместить несколько сот судов и таким образом дополнить средства для всей флотилии. Первый консул приказал инженерам осмотреть местность, в случае удачи он намеревался двинуть туда войска и расположить их лагерем в шалашах, как в Этапле и Булони. Эти две гавани могли вместить до пятисот судов.
Оставалась батавская флотилия, которая собиралась принять корпус генерала Даву и по договору, заключенному с Голландией, оставаться независимой от эскадры, собранной в Текселе. К несчастью, вооружалась она не так деятельно, как французская, и еще не решили, отправить ее из Шельды к берегам Англии под охраной нескольких фрегатов или привести в Дюнкерк и Кале для отправления из гаваней, находившихся по правую сторону мыса Грине. Разрешение этого вопроса возложили на адмирала Брюи. Корпус генерала Даву, составлявший правое крыло армии, приблизился бы таким образом к ее центру. Даже надеялись, что с помощью расширения бассейнов и сужения лагеря можно провести его около мыса Грине и расположить в Амблетезе и Вимре. Тогда французская и батавская флотилии, в совокупности около 2300 судов, поднимая корпуса генералов Даву, Сульта, Нея и резерв, всего 120 тысяч человек, могли выступить одновременно, при одном и том же ветре, из четырех гаваней, находившихся внутри пролива. Два больших военных флота, планировавших выступить из Бреста и Текселя, должны были везти остальные 40 тысяч человек, назначение и действия которых составляли исключительную тайну Первого консула.
В дополнение ко всему прочему надлежало охранять берега от нападения англичан. Все понимали, что по примеру, поданному ими в 1801 году, англичане будут стараться истребить флотилию или сжигая ее в водоеме, или атакуя на рейдах. Итак, надлежало отнять у них возможность доступа как для защиты самых гаваней, так и для обеспечения себе свободного выхода и входа. Сделать это было нелегко, прежде всего по причине формы берега, который был прям, не представлял ни выемки, ни выпуклости и, следовательно, не давал никакого средства стрелять по дальним целям. Этот недостаток, однако, использовали самым замысловатым образом. Перед булонским берегом лежали на море две скалистые косы: одна по правую руку, коса Креш, другая по левую, Эр. Между ними находилось пространство в 2500 туазов, совершенно безопасное и очень удобное для стоянки на якоре. От двух до трех сотен судов могли там свободно поместиться в несколько линий. Исчезая под волнами во время прилива, эти скалы открывались при отливе.