Цезарь прибыл в окрестности Брундизия 9 марта. Он располагал шестью легионами, в том числе ветеранами Восьмого, Двенадцатого и Тринадцатого легионов, а также некоторым количеством новобранцев и когортами из Трансальпийской Галлии, часть которых вскоре была официально преобразована в легион, так называемый Пятый
Цезарь пока что не мог последовать за противником. Войска Помпея собрали и увели большую часть торгового флота в этом регионе. Для сбора новой флотилии понадобилось бы очень много времени. Цезарь не был склонен к ожиданию и обороне, боясь, что инициатива перейдет в руки противника. Наступила весна, и воюющим армиям проще было заниматься снабжением и фуражировкой. Основная масса собственной армии Цезаря — примерно семь легионов вместе с многочисленными союзниками — по-прежнему находилась к северу от Альп. Лучшие легионы Помпея были расквартированы на Иберийском полуострове и, таким образом, оставались отрезанными от своего командира и находились под командованием его легатов. Они до сих пор не проявляли активности, но это вряд ли могло продолжаться вечно, особенно если бы Цезарь собрал все свои силы и подготовился к морскому вторжению в Грецию. Ему не нужен был флот, чтобы достичь Испании, но и легионы противника без труда могли войти в Галлию или Италию. С другой стороны, формирование и подготовка армии должна была занять довольно много времени у Помпея, поэтому его попытка вторгнуться в Италию из Греции в 49 г. до н. э. не имела шансов на успех. Однако Помпей не бездействовал: он со своими союзниками намеревался отрезать поставки провианта в Италию из провинций. Разгром легионов в Испании лишил бы Помпея лучших войск и ослабил его, хотя и не стал бы переломным событием войны. Цезарь без колебаний решил осуществить наступательную операцию в Испании. Он пошутил, что собирается сразиться с «армией без полководца», а после этого разберется с «полководцем без армии». Тем временем Курион отправлялся установить контроль над Сицилией и обеспечить морские поставки сицилийского зерна в Италию. Другое войско отправилось захватить Сардинию [14].
Цезарь установил военный контроль над всей Италией, так как ни один укрепленный город не оказал ему сопротивления. Он хотел поскорее отправиться в Испанию, так как время работало против него, и с каждым месяцем Помпей продолжал укреплять свои силы. Большинство магистратов отправились вслед за Помпеем, как и многие видные сенаторы. Другие остались в Италии, но еще не выбрали, к какой стороне присоединиться. Цезарь хотел пронести заседание сената и надеялся создать впечатление, что государственные органы продолжают действовать даже во время кризиса. Его противники утверждали, что только они имеют право представлять Римскую республику. Цезарь собирался опровергнуть это и доказать, что власть продолжает функционировать в Риме, где ей и надлежит быть, и таким образом подтвердить, что он находится на стороне закона и сражается не с Римской республикой, а против фракции, узурпировавшей власть. Он хотел, чтобы как можно больше сенаторов собралось на заседании, назначенном на 1 апреля. Цицерон еще находился в Италии, и соратники Цезаря написали ему несколько писем с просьбой приехать.