Очевидно, что основные положения христианства и нехристианские гностические учения уже начинали сливаться друг с другом. В IX в. византийские императоры принудительно переселили во Фракию приверженцев двух восточных гностических сект, павликиан и мессалиан, которые позднее объединились с богомилами, «собратьями Бога». После завоевания Болгарского царства Византией в 1018 г. теперь уже в самой империи распространилось еретическое учение. Богомилам удалось найти сторонников среди высшей аристократии, которая имела склонность к философским занятиям, в частности в области космологии, и находилась в религиозном поиске. Движение катаров было привлекательным в XII в. и для аристократии Прованса. Богомилы повлияли также на взгляды византийского монашества. Раскол в рядах богомилов произошел в связи с дальнейшим расширением их деятельности в новых политических условиях Византийской империи, в новой интеллектуальной атмосфере. Старые богомилы определяли себя как церковь «болгар», в то время как «новые» богомилы, которые начали называть себя по области Фракии Драговица, стали Драговицкой церковью. Когда крестоносцы в начале XII в. прибыли в Византийскую империю, они первым делом увидели, что императора беспокоил вопрос, как изгнать богомилов. После того как они были изгнаны (в 1110 г. и после 1140 г.), богомилы разбрелись повсюду, неся с собой свое учение. Их миссионерская активность развивалась прежде всего в Сербии, Боснии и Далмации; затем они проникли в Италию и Францию. В Боснии богомильство стало на время государственной религией; во время правления Бана Кулина (1180–1204) оно превратилось в идеологию сопротивления страны экспансионистским устремлениям Венгрии, поддержанной папством. На Балканах богомилы оказались зажаты между двумя великими церквями и двумя великими империями, Западной Римской и Восточной Римской, но все же они смогли выжить, пока турки не пришли к власти в XV в. И даже это был еще не конец. Уйдя в подполье, богомилы разделились на две ветви. Одна – это радикальное боевое тайное сообщество, положившее начало тайным братствам XIX и начала XX в., которые сыграли свою роль в Первой и Второй мировых войнах. Вторая была пацифистским братством, столь же радикальным, которое с XVI в. объединилось с идеалистами из Западной Европы в Трансильвании, Польше и Моравии и из тех стран проникло в Россию. Считается, что последний богомильский клан в Герцеговине принял ислам в 1867 г. В целом характерные особенности подпольного движения на Балканах, в его религиозном, политическом и интеллектуальном аспектах, могут быть поняты только в свете учения богомилов; и то же самое можно сказать о подпольном движении в Западной Европе, где богомилов преследовали, называя их катарами и болгарами (родовое название для еретиков любого вида).
В Рейнскую область и Северную Францию учение богомилов принесли купцы и, возможно, также разочаровавшиеся во всем крестоносцы, вернувшиеся из Второго крестового похода в 1149 г. Богомилы, изгнанные из Византии, также селились в этих областях. Это была «открытая» (некоторые могут сказать опасно открытая) Европа XII столетия. Переход этих «еретиков» на Запад был «подобен триумфальному шествию; их приветствовали повсюду и встречали их с невиданным энтузиазмом». Богатый город Кёльн был особенно к ним расположен. Бернард Клервоский, самый горячий защитник западного христианства, метал против них громы и молнии, но его не поддержали, и его призывы были напрасны. Основными целями его обличений были их гордыня и лицемерие.
Движение катаров захватило большую территорию между Рейном и Пиренеями всего за два года. «Строгое соответствие их образа жизни и учения имело ошеломительное воздействие». Все классы общества охватило поистине безумие, все сословные различия были забыты. Среди сторонников катаров были духовенство и женщины. Европа переживала первое в ее истории движение Возрождения.
Следуя прецеденту богомилов, катары основали епископства на Западе. Первое было учреждено в Северной Франции, вероятно, в Мон-Эме в Шампани (около 1150–1160?). Следующим было в области Альби в Южной Франции; именно оно дало движению новое название. Миссии альбигойцев были направлены из Франции в Италию, и вскоре они действовали по всей стране от Ломбардии до Неаполя.