Перед уходом в отставку Сахаси мог предложить Кавахаре замену на посту главного секретаря, но министр Мики дал понять, что сам выберет преемника Сахаси. Следующим главным секретарем стал Одзими* Ёсихиса (март 1966 - май 1968), фигура переходного периода, поскольку его иногда считали членом "фракции Сахаси" (во время принятия Закона о специальных мерах он возглавлял Управление по расследованию промышленной структуры в Секретариате), но он также был более ориентирован, чем Сахаси, на проблемы Японии в мировой экономике. Он стал последним вице-министром (196971 гг.), который мог претендовать на то, чтобы представлять старую ориентацию "Киси-Шиина". На пост вице-министра после Сахаси Мики выбрал Ямамото Сигэнобу, бывшего начальника Бюро международной торговли и чиновника, который, служа за границей в посольстве в Бангкоке, в 1966 году стал директором Агентства средних и малых предприятий. Когда Ямамото занял пост заместителя министра, он, в свою очередь, выбрал Кумагаи Ёсифуми в качестве руководителя Бюро предприятий, и в период с мая 1968 по ноябрь 1969 года Кумагаи сменил Ямамото на посту заместителя министра.
В дополнение ко всем нерешенным политическим проблемам после Сахаси команде Ямамото, Кумагаи и Одзими пришлось уделять много внимания внутренним проблемам, связанным с фракциями и падением морального духа, которые сохранялись со времен борьбы Сахаси и Имаи. По общему мнению, Ямамото блестяще справился со своими обязанностями; он является одним из самых любимых вице-министров. Он систематически назначал сотрудников промышленных фракций на посты в международных фракциях и наоборот - политика, которая также отражала его собственную биографию как специалиста по продвижению японской экспортной торговли тяжелым оборудованием и продукцией с высокой добавленной стоимостью, а не текстилем и товарами повседневного спроса (он был первым заместителем министра, чье амакудари было связано с автомобильной промышленностью, где он стал в 1968 году исполнительным директором Toyota Motors). Типичным для кадровой политики Ямамото было назначение Миядзавы Тэцудзо*, имевшего опыт работы в тяжелой промышленности, но не работавшего за рубежом, на должность директора Бюро международной торговли; а также назначение Морозуми Ёсихико, чей опыт работы в Париже и Бюро предприятий, на должность начальника Горного бюро.
Пока эта политика работала достаточно хорошо, но внутри министерства продолжались разногласия по поводу политики Сахаси. Старые кадры, занимавшиеся промышленной политикой, утверждали, что новые лидеры не были настоящими "самураями, выросшими в министерстве" (как Сахаси), и что они склонны проводить политику "иностранного умиротворения" перед лицом требований либерализации капитала. Эти обвинения часто заставляли первых лидеров "международной фракции" проявлять жесткость, как, например, на переговорах по текстилю между США и Японией, чтобы опровергнуть обвинения в том, что они были склонны умиротворять иностранцев. После того как Ямамото ушел в отставку, а Кумагаи стал заместителем министра, руководители министерства решили, что старая фракция Сахаси должна уйти. Кумагаи назначил Морозуми главным секретарем (с мая 1968 по ноябрь 1969 года) и провел тщательную чистку младших соратников Сахаси. После ухода самого Сахаси ни один из членов фракции Сахаси не преуспел в министерстве (за исключением Одзими, который на самом деле был независимым).
Важно понимать, что эта внутренняя борьба фракций взаимодействовала с различными политическими решениями МИТИ и влияла на них в этот период. Новые руководители министерства не сильно отличались от Сахаси по фундаментальным вопросам, но большинство из них служили за границей, хорошо разбирались в "культуре" международной торговли (которая включала такие институты, как МВФ, ГАТТ и ОЭСР, и такие тенденции, как либерализация капитала) и были чувствительны к новым, высокотехнологичным отраслям, которые вскоре должны были прийти на смену сталелитейной, химической и текстильной промышленности. В отличие от таких людей, как Сахаси, их точно можно назвать "космополитическими националистами". Они также были лидерами, которые реформировали министерство в 1973 году и вывели Японию из нефтяного шока.