В течение нескольких месяцев воинственное Английское Содружество подвергло новую республику испытанию на прочность, заставив ее бороться за господство на море. Англия заявила о своем господстве над Ла-Маншем, ветряной трубой голландского процветания, требуя салюта от проходящих мимо военных и торговых судов. Салют, когда английские военные корабли спускали паруса и мичманы, был одновременно и символом английского господства, которое можно было превратить в денежные выплаты, и тактикой, которая делала голландские корабли уязвимыми для нападения. Республика отвергла это требование, отстаивая гроцианскую доктрину "свободных морей", и приготовилась к войне. В конечном счете, война была обусловлена меркантилистской экономикой. Английские купцы и судовладельцы хотели, чтобы Содружество использовало мощный флот, купленный на их налоги, для захвата торговли у голландцев. Как заметил один голландский памфлетист, "англичане движутся против золотой горы, а мы, наоборот, против железной". Это была бы морская война, солдаты не требовались.
С началом войны де Витт возглавил Военно-морской комитет Голландии, отреагировав на обоснованные жалобы Тромпа на неадекватность голландского флота, состоявшего в основном из наемных торговых судов. Такие суда были не только слишком медлительны, чтобы идти в ногу со специально построенными военными кораблями, и слишком слабы, чтобы противостоять тяжелой артиллерии, но и их офицеры-купцы оказались непостоянными. После войны небольшие наемные торговые суда были заменены: во Второй англо-голландской войне флот использовал большие корабли VoC, но не в Третьей. В 1652-4 гг. у голландцев не было ответа на боевой флот, созданный для контроля над Ла-Маншем. Англия заставила голландцев бороться за свою торговлю, победила их в сражении и блокировала Амстердам, где на улицах росла трава. Режим "истинной свободы" потерпел крах.
Англия, входившая в Содружество, представляла собой новый вызов. В отличие от Испании, она разделяла программу "Истинной свободы" по созданию коммерческой морской державы и была готова бороться за первенство. Понимая, что Республике необходим дорогостоящий боевой флот, а также имеющиеся крейсера, де Витт колебался. Он предвидел политические проблемы в государстве, далеком от единства с морской державой. Столкнувшись с экономическим крахом и политическими неурядицами, де Витт создал боевой флот, отвлекая средства от основных стратегических систем республики - армии и пограничных крепостей. В октябре 1652 г. новые морские поражения побудили Генеральные штаты построить тридцать новых линейных кораблей за счет военных налогов и займов. Вскоре после этого де Витт стал пенсильванским советником Голландии, а в июле 1653 г. фактически возглавил государство в качестве пенсильванского раадса. Через два года он вступил в брак с известной амстердамской олигархической семьей Бикер, а в 1659 г. получил герб со шлемом, который был выбит на его карете. Де Витт и его республиканские сторонники связали государство и морскую мощь, сделав новые линкоры национальной, а не провинциальной собственностью, чтобы местные адмиралтейства не смогли продать их после войны. Этот "новый флот" должен был стать постоянным профессиональным боевым флотом.
В Первой англо-голландской войне Республике, чтобы выжить, необходимо было разгромить английский флот и блокировать Лондон до полного подчинения, подобно тому, как она блокировала Антверпен. Смерть Тромпа задолго до постройки новых кораблей деморализовала флот и население, а непродолжительная английская блокада грозила экономическим крахом и подрывала авторитет нового режима. Экономические трудности вызвали внутренние волнения, которые усилили сторонников Штадхолдера. Чтобы минимизировать последствия поражения, потребовалось немалое дипломатическое искусство.
Поражение выявило слабый моральный дух флота. Около половины матросов были иностранцами, заработная плата в Генеральных штатах была ниже, чем в торговом судоходстве, а адмиралтейские колледжи, как известно, платили медленно и плохо кормили. Нередки были мятежи. Голландцы, в отличие от англичан, не допускали импрессинга - насильственной вербовки моряков. Дисциплина среди моряков всех рангов была серьезной проблемой. Десятилетие спустя де Витт признался британскому послу сэру Уильяму Темплу, что поражение в Четырехдневном сражении 1666 г. принесло английским морякам "больше чести нашей нации и непобедимой храбрости наших моряков, чем две другие победы". Он признал, что голландские моряки не устояли бы у своих орудий ни на второй, ни тем более на четвертый день.