Заиконоспасский ставропигиальный мужской монастырь (Никольская ул.) связан с историей русского просвещения. Принадлежащее ему Заиконоспасское духовное училище помещается в здании бывшей Славяно-греко-латинской академии, одного из старейших и лучших образовательных учебных заведений Руси. Из-за тесноты Академия была в 1814 г. переведена в Троице-Сергиеву лавру, а на ее месте размещено духовное училище, рассчитанное главным образом на детей московского духовенства.
В XX столетии в Москве появляются новые обители сестер милосердия. Это Иверская община сестер милосердия (на Б. Полянке), Покровская (Покровская ул.), Александровская (Госпитальная пл.) и наиболее значительная, прежде всего в архитектурном отношении, Марфо-Мариинская обитель на Большой Ордынке. По замыслу ее учредительницы — великой княгини Елизаветы Федоровны, «сестры обители призваны были соединить и высокий жребий Марии, внемлющей вечным глаголам жизни, и служение Марфы, поскольку они опекали у себя Христа в лице меньших братий».
Что же касается отдельных храмов, то в архитектурном плане наибольший интерес представляет церковь Покрова Богородицы в той же Марфо-Мариинской обители (1908—1912) и церковь Воскресения у Сокольнической заставы, в просторечии московском «Кедрово», по имени первого ее настоятеля (1909— 1913). Было также задумано строительство собора Александра Невского (Миусская пл.), не уступающего по размерам храму Христа Спасителя, — в память 50-летия освобождения крестьян от крепостной зависимости. Несмотря на то, что собранной по подписке суммы было совершенно недостаточно, в 1904 г. состоялось освещение земель будущей постройки, а в 1911 г. началось и само строительство по проекту А. Померанцева.
Наконец, в районе Песчаных улиц на средства А. и М. Катковых, потерявших на фронте двоих сыновей, в 1915—1918 гг. строится церковь во имя Преображения Господня.
Но, несомненно, самым оживленным для Москвы тех лет оказывается строительство старообрядческих храмов. Очень внушительным было число церквей старообрядцев, приемлющих Белокриницкое священство и признавших Окружное послание. В Московское Епархиальное управление, возглавляемое архиепископом московским Иоанном, входили 24 храма. В этом числе две соборные церкви — Покрова Пресвятой Богородицы (пр. Рогожского кладбища) и Рождества Христова (Рогожское кладбище). Обслуживались они одним причтом, как и храм-колокольня во имя Воскресения Христова в память Распечатания алтарей, поражающий своими размерами.
Посвящение Покрову Пресвятой Богородицы было наиболее распространенным. Покровскими назывались церкви Остоженской общины (3-й Ушаковский пер.), Замоскворецкой общины (Б. Вокзальный пер.) — после 1905 г., в Гавриковом переулке, на Таганской площади, на Лужнецкой улице (в доме Полежаевой).
Никольско-Рогожская община строит церковь во имя Введения Богородицы во храм на углу Малой Андроньевской и 3-й Рогожской в 1912 г.
Старообрядцы Федосеевского Старопоморского благочестия, не приемлющие священства и брака, располагали семью храмами, находившимися на Преображенском кладбище: соборная — Воздвижения Честнаго и Животворящего Креста Господня, Богоявления, пророка Ильи, Покрова, Преображения Господня, Всемилостивого Спаса и Успения.
Старообрядцы Поморского брачного согласия, не приемлющие священства, располагали частной молельней в доме В. Морозова (Введенский пер.) и построили на месте бывшей молельни в Большом Переведеновском переулке храм во имя Рождества Христова, Успения Богородицы и Николы Чудотворца, а в Токмаковом переулке — Воскресения Христова и Покрова Божьей Матери.
По одной церкви имели старообрядцы, приемлющие священство и не признающие общин (их молитвенный дом на Лужнецкой улице был освящен во имя иконы Казанской Божьей Матери), и старообрядцы, «приемлющие Белокриницкое (Австрийское) священство, не признающие Окружного послания и общины и следующие епископу Иосифу», иначе — иосифовцы, располагающие церковью Сергия Радонежского (угол Б. и М. Вокзальных переулков), и так называемые даниловцы (следующие епископу Даниилу Богородскому). Последние имели церковь на углу Земляного вала и Таганского тупика.
Существовали еще старообрядцы, следующие епископу Иову — иовцы. Свою соборную церковь Свято-Николаевской общины они строят в 1912 г. (Лефортовский пер.), имея, кроме того, храм на Лужнецкой улице — во имя апостолов Петра и Павла.
Церковь великомученицы Екатерины (Ирининская ул.) и молитвенный дом во имя Николая Чудотворца (М. Андроньевская ул.) имели старообрядцы, «приемлющие священство, переходящее от господствующей Греко-Российской церкви, и признающие общину».