Нельсон пребывал в дурном настроении, хуже того – он был напуган. Французский флот выполнил все свои задачи и теперь, по всей видимости, возвращался во Францию. Нельсон испытывал особое беспокойство в отношении выполнения приказа Сент-Винсента (обратить особое внимание «на то, что если экспедиция будет двигаться к Гибралтару, Вам не следует позволять ей пройти пролив до того, как это сделаете Вы, иначе они не дадут Вам вовремя присоединиться к моим силам для того, чтобы совместно воспрепятствовать объединению французского и испанского флотов в заливе Кадис». Теперь французы вполне могли оказаться в западной части Средиземного моря и, в зависимости от наличия у них сведений о местоположении англичан, могли сделать то, о чем Сент-Винсент предупреждал Нельсона, а именно – блокировать Гибралтарский пролив. Он понимал, что теперь охотник мог стать жертвой. Поспешный переход британского флота в западную часть Средиземного моря, в связи с тем что Нельсон слишком задержался в его восточной части, оказался лишь повторением уже имевшей место безуспешной погони. Покинув побережье Египта, англичане через двадцать шесть дней подошли к Гибралтарскому проливу. Здесь, к великому облегчению Нельсона, не было обнаружено никаких следов присутствия французского флота. На самом деле адмирал Брюйе понятия не имел о том, какую возможность предоставила ему судьба. Более всего он был заинтересован в безопасном возвращении в Тулон, что он и сделал, причем как раз в тот самый день, когда Нельсон подошел к Гибралтарскому проливу. Так два флота разминулись в последний раз.
Сент-Винсент не нашел оправданий тому, что Нельсон не смог разбить французов и сорвать их вторжение в Египет. Следующая выдержка из депеши лорду Спенсеру, который был тогда Первым Лордом Адмиралтейства, показывает, как Сент-Винсент расценил действия Нельсона в Средиземном море:
Это было чрезвычайно резкое суждение о человеке, который лишь за год до этого помог Джервису, тогда еще адмиралу, одержать победу при мысе Сан-Висенти и получить титул.
Завоевание Египта