Во многих местах братства содержали свои госпитали, а в некоторых поселениях управляли местным филиалом королевского госпиталя для больных и раненых солдат. Устав братства милосердия в Макао, учрежденного в 1569 г., предписывал оказывать помощь всем в ней нуждавшимся, независимо от цвета кожи и расы, с оговоркой, что в первую очередь благотворительность должна быть направлена на христиан. Здесь, как и повсюду, бурный рост населения привел к тому, что стало нецелесообразным оказывать благотворительность всем множившимся пролетариям, которые за ней обращались. Во многих поселениях благотворительная деятельность братств ограничивалась местными христианскими общинами, хотя их было и так уже довольно много, ведь к ним, во многих случаях, также часто относили рабов. Устав госпиталя в Макао, пересмотренный в 1627 г., предусматривал, что нужно давать достаточное количество риса и рыбы жителям Тимора и неграм, «чтобы питание их было достаточным и удовлетворительным». Это было очень гуманное положение устава, поскольку в официальном законодательстве подобное требование относительно питания рабов встречалось крайне редко, если оно вообще имелось во владениях других колониальных держав.
Председатель попечительского совета был одним из самых важных выборных чиновников, которые служили в братстве. Предъявляемые к нему требования описаны в Лиссабонском уставе 1618 г.
«Председатель всегда должен иметь дворянское происхождение, быть человеком влиятельным и зрелого возраста, иметь благоразумие, рассудительность и доброе имя, чтобы другие братья могли его признать своим главой и беспрекословно слушаться его. Даже если он будет обладать всеми вышеперечисленными качествами, он не может быть избран, если ему не исполнилось по крайней мере 40 лет. Он должен быть терпимым по отношению ко всем несогласным с его мнением. Он должен отойти от всех других дел, чтобы иметь свободное время на выполнение своих многочисленных обязанностей. И для того, чтобы он приобрел необходимый опыт, претендента следует избирать на пост председателя только спустя год после его вступления в братство».
Одно требование постоянно нарушалось. А именно: запрет занимать любой официальный пост в течение всего года нахождения на посту председателя. Знакомство со списком председателей братства в Гоа с 1552 по 1910 г. показывает, что среди них было 14 вице-королей, 11 архиепископов, 2 инквизитора и множество действующих губернаторов, капитанов, государственных секретарей, контролеров казначейства, судей Высокого суда и представителей королевской администрации, как постоянно занятых на службе, так и отошедших от дел. Разумеется, не все из высокопоставленных сановников серьезно относились к своим обязанностям и всю рутинную работу в отсутствие председателя поручали вести секретарям. Однако подавляющее большинство ответственно относились к делам братства. Пост председателя имел большой социальный статус, несмотря на то что он требовал больших затрат. Деллон писал в 1676 г.: «Первоначально только дворяне избирались на эту должность, но в последнее время стали избирать также купцов. Все пожертвования здесь делаются в пользу бедных, и редко случается, чтобы председатель не потратил до 20 тысяч ливров собственных средств к концу годового срока исполнения своих обязанностей… Самые первые граждане Гоа и высокопоставленные лица, не исключая самого вице-короля, стремятся стать членами братства… Они выбирают каждый год нового председателя, что означает, что каждый может внести свой вклад в общее дело».
В Баии на протяжении веков в правлении братства преобладали представители местной землевладельческой аристократии из числа владельцев плантаций сахарного тростника, тем самым оно имело более выраженный олигархический характер в сравнении с попечительским советом Гоа, где членами братства становились высокопоставленные чиновники. Английский историк А.Дж. Рассел-Вуд показал, что едва ли не полдюжины председателей в братствах в Баии в 1663–1750 гг. были отчасти родственниками. Купцы как таковые появились в списках принятых в эти братства около 1700 г., и с 1730 г. количество принятых в братство росло. Подобный процесс отражал постепенное перераспределение благосостояния в Баии по мере того, как доходы, получаемые от владения государственной собственностью, сменялись доходами от финансовых спекуляций и предпринимательской деятельности. В 40-х гг. XVIII в. несколько бизнесменов были избраны председателями братств милосердия Баии, нарушив монополию земельной аристократии.