Действенный и строгий контроль за изданием и распространением книг, верность догматам Церкви (Португалия была единственным государством, решительно и бесповоротно признавшим все постановления Тридентского собора) и консервативный от природы склад характера португальской нации – все эти факторы помогают понять, почему эпоха Возрождения в Португалии была столь краткой. В конце XV и первой половине XVI в. много португальцев отправлялось за границу учиться в университетах Испании, Франции, Бельгии, Италии и Англии (в последней таких было незначительное число) за собственный счет и на средства короны. В этом отношении король Жуан III был особенно щедрым покровителем учащихся; в Парижском университете многие из них были его стипендиатами. Король приглашал также в Португалию знаменитых ученых гуманистов из европейских стран для занятий научной деятельностью и преподавания (среди них фламандец Николас Кленар и шотландец Джордж Бьюкенен). Но появление все новых ересей в Северной Европе, с одной стороны, и набирающая силу Контрреформация, с другой, заставили его в последние годы жизни перейти на более консервативные позиции. Несколькими годами ранее подобные изменения произошли и в политике императора Священной Римской империи Карла V. После смерти короля, когда начало расти влияние иезуитов и инквизиции, триумф религиозной ортодоксии стал полным. На учебу за границу португальских студентов больше не посылали, чтобы они, как было раньше, могли по возвращении занять профессорские должности в Университете Коимбры. Идеалы Эразма Роттердамского, имевшие достаточно приверженцев при дворе королей Мануэла I и Жуана III, уже никто не исповедовал открыто после 1580 г., хотя упоминания о них все еще можно было найти в португальской литературе вплоть до начала XVII в.
Ни одна национальная культура не в состоянии нормально развиваться, если она не будет, время от времени, оплодотворяться новыми идеями извне. Такое было просто невозможно в Португалии между 1560 и 1715 гг. вследствие вышеуказанного фактора. Особенно сильным был страх перед иностранной ересью. Эта опасность еще не существовала в 1483 г., когда Жуан II Совершенный позволил двоим французским книготорговцам ввозить беспошлинно столько книг, сколько они пожелают, «потому что это полезно для общественного блага, когда в королевстве имеют хождение многие книги». Столетие спустя этот просвещенный подход был полностью пересмотрен. Отныне единственной идеей государства и церкви стал запрет всех иностранных изданий, за исключением книг по каноническому праву, агиографических трудов и прочей безобидной литературы. Цензура, конечно, не всегда и не везде применяла строгий подход. Так, португальские иезуиты или, вернее, часть из них на лекциях в Коимбре и Баии говорили о системе кровообращения, описанной впервые Уильямом Гарвеем. Однако если в Северной Европе и Италии философские воззрения Галилея, Бэкона, Декарта, Ньютона, Гюйгенса, Гоббса и Лейбница и других ученых обсуждались более или менее открыто, то иезуиты в Португалии (также, как и в Испании) запретили обсуждение их идей и избегали даже упоминать о них на лекциях. Такое положение сохранялось вплоть до 1746 г.
Португальцы не смогли воспользоваться плодами научных открытий, в которые внесли значительный вклад их соотечественники штурманы Дуарти Пашеку Пирейра и Жуан ди Каштру, математик Педру Нуньеш и врач Гарсия д’Орта и др.
Случилось так, что именно голландцу ван Линсхотену выпало познакомить европейцев с морскими лоциями (
К чести иезуитов, они не только поддерживали училища и университеты, но содержали также своего рода детские сады и начальные школы, как в самой Португалии, так и во всех ее колониях. Ученики часто устраивали спектакли и представления, даже в таких негостеприимных местах, как в центре работорговли Сан-Паулу-де-Луанда. Пьесы, исполняемые старшими учениками, были большей частью написаны на латинском языке. В этом неолатинском театре португальцы показали себя добрыми католиками и хорошими латинистами.