На пепелище первой библиотеки Конгресса предстояло появиться новой, намного лучшей. Главным руководителем ее восстановления стал один из интеллектуальных архитекторов американской революции и основания Соединенных Штатов Томас Джефферсон. К 1814 году бывший президент жил наполовину в отставке в Монтиселло, штат Вирджиния, в ста милях к юго-западу от Вашингтона. Личное книжное собрание Джефферсона, возможно, самая передовая и обширная частная библиотека в Америке того времени, создавалось в течение всей жизни серьезного читателя, каковым тот являлся. Джефферсон понимал, что значит потерять библиотеку в огне пожара: его первая коллекция книг по юриспруденции сгорела в 1770 году, и ему пришлось восстанавливать свое собрание заново. Несколько недель спустя после пожара Вашингтона Джефферсон написал тщательно заготовленное письмо Сэмюэлю Харрисону Смиту редактору базировавшейся в городе ведущей республиканской газеты: «National Intelligencer»;
Последовал долгий период дискуссий и споров о ценности предложения Джефферсона, включая напряженные дебаты об относительной пользе крупных денежных трат на восстановление утерянной библиотеки, когда в стране не хватает ресурсов и средства лучше направить на военные цели. В последующие столетия в истории библиотеки подобные аргументы повторялись много раз.
Предложение Джефферсона снабдить «американского государственного деятеля» всем необходимым (естественно, в те времена все эти политики были мужчинами) оказалось счастливой случайностью, поскольку как на восстановление изначального собрания в 3000 томов, так и на создание подобия личной библиотеки Джефферсона из 6000 или 7000 книг потребовалось бы немало времени и сил. Соответственно, Джефферсон предлагал короткий путь к крупному библиотечному собранию, дополнительная ценность которого состояла в том, что оно было собрано человеком, построившим систему правления нового государства, время от времени пользуясь в качестве интеллектуальной подпитки теми же самыми книгами.