После того как сербское ополчение разрушило мечеть и католическую церковь в городе Добой, из Белграда прибыл спецназ («красные береты») в поисках записей о крещении в католическом ректории. К счастью, по словам приходского священника, «добрые люди из местных сербов» спрятали реестры по его просьбе, поскольку он осознавал неминуемость очередного шага в культурном геноциде, которому подвергся город [13]. В Герцеговине, юго-западном регионе страны, целью для сербов также стал исторический город Мостар. Архивы Герцеговины неоднократно подвергались обстрелам, так же как библиотека католического архиепископства и городская университетская библиотека. Разрушение прекрасного исторического моста в Мостаре стало символом ущерба, нанесенного культурной жизни Боснии за время конфликта, но миллионам уничтоженных книг и документов в сотнях публичных библиотек и архивов пресса практически не уделила внимания.
Пострадали также другие библиотеки и архивы в Сараево. Первой жертвой стал Восточный институт, преднамеренно обстрелянный фосфорными снарядами 17 мая 1992 года, отчего погибла вся его коллекция. Обстрел и последовавший за ним огненный ад уничтожили 5000 рукописей, 20 000 османских документов, свыше ста кадастровых реестров османского периода и справочный фонд из 10 000 печатных книг и журналов. Не уцелел даже каталог собрания. Как и в случае с Национальной университетской библиотекой, никакие соседние здания обстрелу не подвергались [14].
Были разрушены также библиотеки десяти из шестнадцати факультетов Университета Сарево, в основном в течение кошмарного 1992 года, потеряв, по оценкам, 400 000 томов. 8 июня 1992 года сербские войска захватили францисканский монастырь в пригороде Сараево и изгнали монахов. Лишившаяся защиты монастырская библиотека была разграблена, и некоторые из ее 50 000 книг то и дело всплывали на европейском антикварном рынке [15].
В сентябре 1992 года, когда был обстрелян отель «Холидей Инн» в Сараево, репортер Би-Би-Си Кейт Эйди гневно потребовала от сербского командира батареи объяснить, почему его целью стал отель, где жили все иностранные корреспонденты. Последовало ошеломляющее признание, сопровождавшееся множеством извинений: оказалось, что целью на самом деле являлся Национальный музей на другой стороне улицы, и снаряды попали в отель по ошибке [16].
По имеющимся оценкам, всего за время конфликта были уничтожены 480 000 метров архивов и рукописей, хранившихся в учрежденческих собраниях по всей Боснии, и около 2 миллионов печатных книг.
С того момента, как в Национальной университетской библиотеке начали рваться снаряды, предпринимались напряженные усилия для спасения ее собраний. Библиотечный персонал и жители Сараево - сербы, хорваты, евреи и мусульмане - вместе образовали живую цепь, чтобы вынести книги, но сумели спасти меньше 10 % фондов. Библиотечное обслуживание героически продолжалось - свыше ста студентов сумели завершить во время осады дипломные работы, несмотря на кошмарные условия. Восточный институт продолжал проводить семинары и симпозиумы, а его сотрудники работали из дома. Предлагали свою помощь многочисленные группы, от международных библиотечных ассоциаций до отдельных библиотек, таких как библиотека Мичиганского университета и Университета Гарварда. Вскоре заверения международного сообщества о поддержке восстановления библиотеки подтвердило ЮНЕСКО.
Ремонт здания библиотеки проводился поэтапно, начиная с 1996-1997 годов (за счет пожертвований бывшей метрополии, Австрии), сперва с целью просто укрепить строение. 30 июля 1998 года Всемирный банк, ЮНЕСКО и город Мостар обратились с призывом к восстановлению знаменитого городского Старого моста, что привело к соперничеству по международному финансированию бывшей Югославии. Всемирный банк рассматривал мост в Мостаре как «символ всей Боснии», и на этот проект международным сообществом были брошены огромные ресурсы, из-за чего оказались без внимания почти все остальные инициативы, связанные с культурным наследием страны [18].
Тем временем проект по восстановлению библиотеки сталкивался со все большими политическими проблемами. В 1999 году Европейская комиссия выделила второй транш финансирования, хотя работа началась лишь в 2002 году и снова остановилась в 2004-м. Через 10 лет после окончания войны библиотека все еще лежала в руинах, непонятно было даже, кому принадлежит здание - библиотеке или городу. У обоих имелись разные взгляды на то, какой должна быть функция здания после реконструкции. Но в конечном счете, после дальнейшего финансирования со стороны Испании и ЕС, здание было отстроено и теперь является памятником 15 000 жизням, потерянным во время осады Сараево. В балканских войнах 1990-х годов погибли тысячи людей, миллионы лишились жилья и другой собственности. Этнические чистки, столь потрясшие мир и приведшие Милошевича и других на скамью подсудимых в Гааге, затмили параллельную трагедию -утрату интеллектуальной и культурной памяти региона из-за преднамеренной жестокости в отношении библиотек и архивов.