Дивизия состояла из казаков, мобилизованных русских крестьян, казахов (сведённых в т. н. алаш-ордынские полки), афганцев, уйгуров, китайцев, составлявших отдельный Маньчжурский полк. В докладе начальника Особой канцелярии, выполнявшей функции белогвардейской контрразведки, особо отмечалось, что «китайцы атамана Анненкова наводят на жителей страх и заставляют жителей покидать свои дома». Автор доклада цитирует письмо одного из анненковских солдат: «Из Андреевки все ушли, боялись китайцев Анненкова, которые обращаются не по-человечески (бесчеловечно)».
С января 1919 г. Анненков действовал в Семиречье, в основном на юго-востоке Семиреченской области (Копальский и Лепсинский уезды). Командир II Степного Сибирского армейского корпуса (с 26.11.1919, сменил генерала И. С. Ефтина). Командующий отдельной Семиреченской армией (с конца 1919), созданной из частей II Степного Сибирского армейского корпуса и Отдельной Оренбургской армии
Главной задачей для армии Анненкова была ликвидация Черкасской обороны — сопротивления удерживаемых красными отрядами сел Лепсинского (ныне Саркандский район)) и Копальского уездов. В занятых населенных пунктах Анненков действовал и убеждением, и принуждением. 10 января 1919 г. он издал приказ населению занятого Урджарского района, в котором говорилось: «Вверенный мне отряд прибыл в Семиречье для борьбы с большевиками, для водворения правопорядка, тишины и спокойствия. В отношении населения мы будем держаться совершенно одинаково беспристрастно, будь то казак, крестьянин или киргиз. На старое мною поставлен крест, так как многие из нас были, благодаря своей темноте, в заблуждении. Наказаны будут только те, кто сознательно вел вас к этой разрухе. Но в будущем, предупреждаю, будет жестоко наказан всякий, кто вновь будет замечен в преступлениях против существующего государственного порядка, насилиях, грабежах и других преступлениях.» В занятых войсками Анненкова районах запрещалась продажа спиртных напитков. Виновные в их изготовлении и продаже предавались военно-полевому суду. Анненков распорядился арестовывать на 14 суток пьяных и налагать на них штраф в размере одной тысячи рублей. Своеобразно относился Анненков и к военнопленным: многих он привлекал для службы в своих войсках. Как писал Анненков, красноармейцы принимались в его части, дабы искупить свою вину кровью. Более того, в личном конвое атамана, состоявшем из 30 казаков, половину составляли бывшие пленные красноармейцы, отличившиеся особым мужеством в боях{29}
.К июню 1919 г. белые войска смогли организовать наступление, добившись к августу временных успехов. Черкасская оборона пала. Три роты красноармейцев во главе с командирами сдались в плен, часть их затем приняла участие в боях в составе анненковской дивизии.
Однако перелом в пользу Красной армии, происшедший летом 1919 г. по всему Восточному фронту, сказался и на положении дел в Семиречье. Главная опора белых — город Семипалатинск — 10 декабря был занят частями Красной армии. Командование белых войск пыталось организовать сопротивление разрозненных частей, но изменить ситуацию в свою пользу уже не могло. 29 февраля 1920 г. командование Красной армии предъявило Б. В. Анненкову ультиматум с требованием сложить оружие, однако он отказался.
В начале 1920 г. в армию Анненкова влились остатки Оренбургской армии генерала А. И. Дутова. Из 20 тысяч бойцов Дутова через голодную степь в Семиречье прошли 11–12 тысяч. При этом 90 % из них были больны тифом, что ослабило силы белогвардейцев. К тому же, согласно ряду источников, анненковцы недоброжелательно относились к оренбуржцам, грабили их.
Красноармейская разведка доносила, что в сотнях Анненкова нет орудий и пулеметов, «патронов на людях от 20 до 60: Штадив имеет зеленый флаг с белым черепом и костями и надписью „С нами Бог“».
В результате наступления частей большевистского Туркестанского фронта к концу апреля были заняты основные населенные пункты Семиречья.
Информация об обстоятельствах ухода Анненкова в Китай противоречивая.
Согласно одному из источников, в ночь на 25 марта 1920 г. Б. В. Анненков в сопровождении 4 тысяч бойцов и отступавшего населения ушел за границу, объявив специальным приказом о прекращении вооруженной борьбы и праве каждого солдата и офицера самостоятельно определить свою дальнейшую судьбу.
Принявший от него командование полковник Асанов приказал оставшимся силам Семиреченской армии «считать себя войсками РСФСР» и ожидать распоряжений командования Красной армии{8}
.Согласно другим источникам, Анненков с 5-тысячным (по другим данным, 18-тысячным) отрядом отошёл к китайской границе, обосновавшись у перевала Сельке, которое назвал «Орлиное гнездо». В Ярушинской бригаде, драгунском полку и сербских частях вспыхнуло восстание тех, кто не желал уходить в Китай, откуда Анненков планировал продолжить борьбу с большевиками, подавленное с исключительной жестокостью.