Первой реакцией османов на французское вторжение стало подписание союзного договора с Россией в 1799 году и совместная военно-морская экспедиция с целью изгнания французов с Ионических островов. Обе державы создали Республику Семи Соединенных островов и взяли ее под свою совместную защиту с 1800 по 1807 год. Они по-разному понимали, что это значит. Османы рассматривали Семь островов как данническое государство в той же категории, что и Дунайские княжества и Рагузская республика. Политика России была запутанной, что отражало путаницу между имперским центром и местными военачальниками. Острова быстро стали пешкой в сложной дипломатической игре. Сначала Александр I рассматривал возможность создания русской военно-морской базы в рамках подготовки к кампании Третьей коалиции против Наполеона. Османы отказались присоединиться к коалиции, и Наполеон убедил их в том, что их главный враг - Россия. Столкнувшись с сербским восстанием в 1804 году и втянувшись в маневры против России (1806-1812), османы были вынуждены отказаться от протектората над Ионическими островами, которые французы вновь заняли в 1807 году по условиям Тильзитского мирного договора с Россией. Французы были окончательно вытеснены англичанами, чья оккупация островов в 1815 году была признана османским султаном только в 1820 году. Запутавшись в многочисленных соперничествах между османами, французами и русскими, местные жители, в основном православные христиане, объединились с православными русскими против ненавистных католических французов и мусульманских османов. Но русскому правительству не удалось осуществить свой первый и последний прорыв в Средиземноморье. Оно уступило контроль над Ионическими островами англичанам.
Во время этих дипломатических и военных перемен Османский центр был вынужден полагаться на таланты своего амбициозного проконсула в регионе, Али-паши, генерал-губернатора Иоаннины с 1787 по 1820 год, которого часто называли "мусульманским Бонапартом".
В борьбе за Тройственный континент он выступал в качестве защитника прибрежных островов и анклавов Османской империи от венецианцев и западных держав. Заслужив там репутацию Мухаммеда Али, он стал ключевой фигурой в попытке Османской империи подавить греческое восстание.
Сербское восстание
Сербское восстание 1804 года кардинально изменило расстановку сил на западе Балкан. Сербское сопротивление османскому владычеству имело долгую предысторию. Сербское пограничное общество напоминало казаков с их независимым, полукочевым образом жизни, основанным на скотоводстве, а не на земледелии. Они гордились своей воинской доблестью и стойко защищали свою религию, противостоя как католическому, так и мусульманскому давлению. Россия была далеким источником вдохновения и потенциальной поддержки, не угрожая сербам завоеванием и ассимиляцией. К концу XVIII века габсбургские сербы стали наиболее сознательными из всех славянских народов Монархии. Они были готовы отреагировать на сигнал вооруженного сопротивления со стороны своих собратьев по османской границе, где миграция значительно увеличила их численность в ключевом пограничном османском пашалыке Белграде с примерно 60 000 в 1739 году до 200 000-230 000 в 1800 году.
Сопротивление османскому владычеству коренилось в коллективной жизни крестьянской деревни, духовно поддерживаемой православной церковью и вооруженной опытом военных действий на границе. Его территориальным центром был Белградский пас¸алик, где еще не произошел переход от тимара к системе чифтлик. В результате крестьянин, хотя и был издольщиком, был лично свободен и сохранял свои традиционные права на пользование своим участком. Все деревни были сербскими; мусульманские землевладельцы обычно жили в городах. Тесная социальная организация крестьян давала им сильное чувство коллективной идентичности, основанное на задруге и совете старейшин или нотаблей, которые избирали районного старосту (кнез). Для обсуждения общих проблем нотабли периодически собирались в одном из центральных мест. Поначалу они довольствовались сотрудничеством с османским правительством и часто использовали свое положение для приобретения земли или налогового хозяйства. Внутри деревень в традиционной морали прославлялось доосманское прошлое, поддерживался миф о героическом поражении христианской коалиции от турок на Косовом поле в 1389 году, хотя длинная письменная версия эпоса была создана в XIX веке. Сербские крестьяне в силу своей социальной организации и культурного мировоззрения были лучше, чем русские крепостные, подготовлены к самостоятельным вооруженным действиям в защиту своих интересов.