Но для проведения аграрной реформы, столь же трудной, сколь и продолжительной, требовалось время – 10-15-20 лет, как планировал Столыпин. К 1 января 1916 г. из общин вышли 2,5 млн домохозяев, 26 % общинных дворов и около 15 % земель крестьянских общин. Из них 53 % продали свои наделы, став наемными работниками в городах. Беднота, оставшаяся в деревне, питала злобу против «кулаков», еще не ставших сельской буржуазией. Но и те и другие стали основой для антипомещичьих выступлений.
Надо сказать и о менее известной подготовке конституционной реформы. Под руководством Д.М. Сольского в Государственной канцелярии подготавливался проект основных законов, развивающих трансформацию самодержавия в конституционную монархию с расширением полномочий Государственной думы. Среди противников перемен оказался Витте, с горячим упорством добивавшийся внесения в проект поправки: «Императору Всероссийскому принадлежит верховная самодержавная власть. Повиноваться власти Его не только за страх, но и за совесть Сам Бог повелевает». Не менее горячо Витте проталкивал решение городской думы о переименовании Каменоостровского проспекта в «проспект графа Витте».
Показательно, что сменивший Столыпина на посту главы правительства В.Н. Коковцов в своей деятельности уже не обходился без Думы. Николай в письме к матери 27 сентября 1909 г. писал, насколько трудно убедить Коковцова ассигновать деньги, минуя нижнюю палату, ибо его принципом стало: правительство действует через закон, невзирая на желания министерских или придворных кругов. В противостоянии царского двора и Совета министров император все чаще брал сторону второй стороны.
Современное общество – общество свободных людей, за десятилетия после начала модернизации постепенно менялось мировосприятие и мировоззрение больших масс людей, принимавших систему ценностей секулярного общества. В то же время иная часть общества стремилась сохранить свою веру. Внутри православной церкви возникает готовность священнослужителей к более самостоятельному, без жесткого пригляда государства, течению церковной жизни. Поэтому частью политики реформ Николая II стал курс веротерпимости и расширения прав Русской церкви.
17 апреля 1905 г. император подписал указ «Об укреплении основ веротерпимости», причем за день до этого в телеграмме своему дяде, генерал-губернатору Москвы великому князю Сергею Александровичу, разрешил распечатать алтари закрытых старообрядческих часовен и совершать в них церковные службы. Были сняты ограничения при устроении общин
В названном указе ничего не говорилось о правовом положении православной церкви, на что указали государю. В марте 1905 г. Николай II рассмотрел доклад Святейшего Синода о необходимости проведения широкой церковной реформы, включающей созыв Поместного собора (не созывавшегося два столетия), изменения управления Церковью и норм церковно-государственных отношений, расширение прав церковных приходов и других мер, которые повысили бы самостоятельность Церкви. Тем самым император продолжал политику своего деда Александра II, который в указах от 1867 г. и 1869 г. начал разрушение сословного принципа жизни русского духовенства.
Николай II согласился с необходимостью созыва собора для решения назревших проблем церковной жизни, но указал на нежелательность его созыва «в переживаемое ныне тревожное время». В декабре 1905 г. в высочайшем рескрипте на имя митрополита Санкт-Петербургского Антония (Вадковского) было признано «благовременным» приступить к «некоторым преобразованиям в строе нашей отечественной Церкви на твердых началах священных канонов, для вящего утверждения Православия». С марта по декабрь 1906 г. в Петербурге работало Предсоборное присутствие, занимаясь разработкой проекта реформ, в частности наметив восстановить патриаршество. Резко против таких планов до своей кончины был К.П. Победоносцев, считавший русское самодержавие религиозной, а не светской идеей и видевший Святейший Синод орудием политической воли светской власти. Однако реальная свобода Церкви оказывалась возможной лишь в светском государстве, и введение начал веротерпимости стало началом такой эволюции государства, вынужденного отказа от созданной еще Петром I синодальной системы. В феврале 1912 г. было создано Предсоборное совещание, которое разрабатывало уже регламент созыва и деятельности Поместного собора. Созыв его был отложен из-за начавшейся войны.