Между тем Департамент здравоохранения штата Нью-Йорк сообщил о доказательствах наличия флавивирусной инфекции в анализах пациентов. Флавивирусы – это группа небольших РНК-содержащих вирусов с положительной полярностью генома. К этой группе относится вирус желтой лихорадки (см. главу 5)2,3
. После укуса комара-переносчика у жертвы развивается инфекция, которая добирается до мозга, скорее всего, посредством циркуляции в крови, хотя также возможно распространение внутри организма через периферические нервы. Flavus с латыни переводится как «желтый». Несколько членов семейства флавивирусов переносятся комарами, вызывают энцефалит, а в качестве естественных хозяев выступают птицы. Для идентификации патогенов в крови или тканях пациентов обычно используются антитела к специфическим флавивирусам, но они часто перекрестно реагируют между различными подвидами вирусной группы. Следовательно, поставить точный диагноз (определить подвид вируса) можно, прежде всего, путем изучения его генетической последовательности с ее уникальными особенностями.Наряду с множеством других обязанностей CDC
держит лаборатории для идентификации необычных или экзотических вирусов и других патогенов. Одна такая лаборатория (активно участвующая в расследовании) – Отделение трансмиссивных инфекционных заболеваний в Форт-Коллинзе, штат Колорадо. Это подразделение занимается вирусными и бактериальными заболеваниями, передающимися комарами и клещами, и предоставляет лабораторные услуги по диагностике таких трансмиссивных патогенов. Они же занимаются оценкой методов предотвращения, лечения и борьбы со вспышками трансмиссивных заболеваний.К началу сентября 1999 года образцы крови и спинномозговой жидкости, ранее взятые у госпитализированных пациентов и отправленные в лабораторию штата Нью-Йорк, а также в CDC
, были протестированы серологическим методом. Результаты показали сильную реактивность в отношении вируса энцефалита Сент-Луис, члена семейства флавивирусов, который ранее не был зарегистрирован в Нью-Йорке. Однако вирус энцефалита Сент-Луис стал причиной большинства вспышек этого переносимого комарами заболевания нервной системы в Соединенных Штатах. Этот вирус обитает в нижних 48 штатах и вызывает в среднем 30–40 случаев энцефалита в год.История продолжала набирать обороты. Число пациентов с подозрением на энцефалит приблизилось к 40 только в Нью-Йорке, при том что обычно столько случаев регистрировалось во всей стране за год. В больницу Флашинг в Куинсе был госпитализирован восьмой пациент. И снова отмечались симптомы со стороны ЦНС и мышечная слабость. Отделение трансмиссивных инфекционных заболеваний CDC
с помощью твердофазного иммуноферментного анализа (ИФА) на антитела подтвердило идентификацию вируса энцефалита Сент-Луис и исключило несколько других вирусов. Для ИФА исследователь выделяет антигены (белки, стимулирующие иммунный ответ) нескольких вирусов. Эти антигены помещают в чашку вместе с сывороткой крови пациента. На основе реакций, полученных во время этих тестов, в пресс-релизах говорилось, что CDC подтвердили вспышку энцефалита Сент-Луис в Нью-Йорке. Департамент здравоохранения Нью-Йорка инициировал программу борьбы с комарами, начал информирование общественности об этой болезни и открыл горячую линию. Федеральное бюро расследований поставили в известность о необычной инфекции в Нью-Йорке, чтобы те могли оценить, было ли это биотеррористической атакой. Теперь горячие линии захлестнули сообщениями о продолжении гибели большого количества птиц. В офисе CDC в Атланте с помощьюантител, используемых в качестве иммунохимических красителей в реакции иммуноферментного анализа, было показано, что ткани мозга недавно умершего пациента содержат флавивирусные антигены. Смертность птиц еще больше выросла в зоопарке Бронкса, по всему Нью-Йорку и в его окрестностях. Первый человек за пределами Куинса, давший положительный результат на этот вирус, был зарегистрирован в Бруклине, а третий пациент умер в больнице Флашинг. По мере того как число пациентов с подозрением на флавивирусную инфекцию росло по всему Нью-Йорку, газета The New York Times сообщила, что работники здравоохранения расследуют и дополнительные случаи, еще не включенные в официальную статистику. Еще восемь пациентов умерли от энцефалита, а 15 больных жителей Нью-Йорка и округа Уэстчестер предположительно являлись носителями вируса энцефалита Сент-Луис5.