Разделенная когда-то на Македонию Первую на юге и Македонию Вторую на севере, территория, урезанная славянской миграцией и Болгарским царством и сохранившая только регион Фессалоники, Халкидики и низины Струмы, образовала фему Фессалоника. В XI в. земли павшего Болгарского царства были присоединены к северной Македонии, в результате была создана новая фема Болгария, которая в конце следующего века вошла в состав Второго Болгарского царства. С 1205 г. византийская фема Фессалоника с Фессалией на юге стала латинским королевством, вскоре присоединенным к Эпирскому деспотату. Урезанная с севера Сербской империей, византийская Македония была восстановлена еще раз в середине XIV в., но некоторое время спустя попала под турецкое владычество.
Между Балканскими горами, Эгейским и Черным морями, Струмой (Стримон) и водоразделом, который возвышается над низиной Софии (Сердика), к западу от Родоп, располагалась Фракия. Перед стеной Балканских гор, на севере, некоторые бассейны, защищенные массивом Анти-Балкан, были особенно плодородны. Главным городом этой территории был Сливен (Стилбнон). Оттуда по некоторым речным долинам можно было проникнуть в обширный бассейн Марицы (Эброс), который и объединяет всю Фракию. Верхняя часть этого бассейна около Пловдива (Филиппополь) очень плодородна и подвержена влиянию средиземноморского климата. Другими центрами этого региона были Станимака (Станимах), Стара Загора (Вероя) и Ямбол, крепости, которые в XII в. стали важными торговыми городами. Холмистый ландшафт объединяет верхнюю Марицу (Эброс) с негостеприимными берегами Черного моря, заливом Бургаса, на северном побережье которого два порта Анхиал и Месемврия занимались торговлей и рыбной ловлей. Родопы, а затем Истранджа Даг и высокие холмы, которые их объединяют, отделяют северную Фракию от южной. Берега нижнего течения Марицы покрыты холмами, на которых выращивают шелковицу по меньшей мере с первой половины XV в. У слияния рек Марицы и Тунджи (Тонзос), на невысоких холмах, у точки пересечения дорог, находится крупный и укрепленный город Адрианополь, который защищает столицу с севера; около устья реки находится порт Айне. Каменистое плоскогорье, расположенное на юге, покрыто степью и кустарником и пригодно для скотоводства. Оно отделяет бассейн Марицы от побережья Пропонтиды и Константинополя.