В таком клубке противоречий между лоялистами и мятежниками, католиками и протестантами, англичанами и ирландцами неудивительно, что в английских войсках короля то тут, то там слышалось какое-то возмущенное бормотание, какие-то позывы к бунту, когда из Ирландии стали прибывать эти новые проблемные союзники. Первыми были правительственные войска Ормонда, почти все протестанты и англичане или люди английского происхождения. Естественно, они высаживались в портах бристольского канала или в Честере, в тех самых регионах, которые два года назад с большим беспокойством принимали суда с бежавшими из Ирландии поселенцами. Кроме того, в прошлом Чешир в течение двух поколений отправлял в Ирландию большое число колонистов, поэтому дворяне этого региона с особенной горечью возмущались Прекращением, которое считали предательством поселенцев. Проблемы начались сразу же. Солдат из этих войск постоянно называли «ирландцами», а беженцы, обосновавшиеся в Честере, утверждали, что узнавали среди них убийц своих мужей и сыновей. Люди повсеместно вели себя враждебно по отношению к вновь прибывшим, отказываясь пускать их на постой или кормить. На западе страны в Бриджуотере войска роялистов взбунтовались и отказались служить вместе с ними. Иногда ситуация еще больше осложнялась, если солдаты правительственных войск из Дублина, которые вели тяжелую войну с ирландскими католиками, с возмущением обнаруживали в армии английского короля офицеров-католиков. Одна рота наотрез отказалась помогать паписту, владельцу замка Уордор, освобождать его дом от протестантского гарнизона, размещенного там силами парламента.
Еще в Ирландии у Ормонда возникали проблемы с некоторыми из его офицеров. Так, полковник Майкл Джонс отказался исполнять свои обязанности, перед этим подав петицию против перемирия. Ормонду пришлось арестовать профессионального шотландского военного Лоуренса Кроуфорда, который яростно возражал против перевода его войск в Англию, где им пришлось бы воевать бок о бок с папистами. Одно время губернатор Дублина, человек хорошо известный и любимый во всех слоях армии как «честный Джордж Монк», отказывался давать особую клятву верности королю, которую должны были дать все офицеры, отправлявшиеся в Англию. Ормонд, стремясь, чтобы король не потерял особо ценного профессионального воина, отправил Монка в Англию под почетной опекой в надежде, что личная встреча с его величеством разрешит его сомнения.
Осенью 1643 г. ситуация глазами парламента по-прежнему вызывала тревогу, хотя ее заметно облегчило освобождение Глостера и благополучное возвращение Эссекса. Гарнизон Рединга пришлось эвакуировать, и кавалерия Руперта могла беспрепятственно совершать рейды в Чилтернс, подвергая опасности подходы к Лондону. По-прежнему сохранялась реальная возможность, что король может заставить свою столицу сдаться раньше, чем на помощь ей придут шотландцы.
В то время как Хоптон, получивший полномочия набирать рекрутов в графствах Суррей и Суссекс, пытался продвинуться к югу от Лондона, Руперт планировал перекрыть каналы снабжения города из Мидленда. 6 октября силы роялистов под командованием сэра Льюиса Дайва захватили Ньюпорт-Пагнелл. Эссекс рассчитывал, что этот уютный маленький городок в тростниковых зарослях Бэкингемшира станет на зимние месяцы «теплым гнездышком» для его усталых солдат. Но Ньюпорт представлял собой нечто большее, чем просто удобное место для зимних квартир, он был ключевым пунктом сухопутных и речных коммуникаций, по которым в Лондон шли товары и взносы из восточных графств. После захвата его роялистами оказался перекрыт один из каналов, за счет которых жил город.
Парламент продолжал требовать денег сверх регулярных взносов. Из-за ослабления торговли акцизы приносили слишком мало. Вестминстер не мог удовлетворить законные требования армии и флота и должен был ускорить подготовку к приходу шотландцев. Решено было собрать почти 70 000 фунтов с помощью принудительного займа. Купцы-авантюристы откликнулись первыми и дали 30 000, но ресурсы Сити были истощены до предела, а роялистское пиратство в открытом море угрожало всем товарам, направлявшимся в Лондон. Кроме того, начинала чувствоваться конкуренция со стороны Бристоля. Нехватка топлива, которая очень расстраивала жителей, в случае холодной зимы стала бы серьезной проблемой, поэтому был выпущен приказ о вырубке деревьев – начиная с королевских парков – в радиусе 60 миль, чтобы обеспечить Лондон дровами. Шотландские союзники парламента перевели угольные шахты Файфшира на более длинный рабочий день и направили большую часть угля в Лондон, невзирая на требования собственных, более выносливых земляков.