В сентябре и октябре, пока британское правительство намеревалось отправить адмиралу Кокрейну больше войск, чем он просил, сам Кокрейн начал осознавать, что эта экспедиция, вероятно, не будет таким простым делом, как он представил британскому правительству в июне. Корабли, которые должны были доставить майора Николса и его морских пехотинцев, вышли из Гаваны в начале августа и прибыли к устью Апалачиколы 13-го числа. Люди Николса сошли на берег, но обнаружили, что британский индейский агент уехал в Пенсаколу, чтобы вести работу с криками, нашедшими приют в окрестностях этого места. Когда британские корабли с Николсом и его отрядом приплыли туда, выяснилось, что испанцы опасаются нападения американцев, и британские морские пехотинцы заняли местный форт. 29 августа майор Николс выпустил высокопарную прокламацию, обращенную к жителям Луизианы, с просьбой помочь «в освобождении земли их отцов от слабоумной и вероломной власти». Он предлагал даже обитателям Кентукки восстать против американцев в пользу британцев.
В начале июня капитан Пигот сообщил, что Мобил можно с легкостью захватить небольшими силами при содействии индейцев и при поддержке малых военных судов. Даже тогда он был слишком оптимистичен, а к сентябрю Эндрю Джексон вдохнул новую энергию в настроения защитников Мобила. В начале лета главная задача Джексона состояла в том, чтобы завершить покорение криков и добиться подписания договора об отчуждении их земель. Но как только в форте Джексон был подписан этот договор, он уже 11 августа отправился вниз по рекам Куса и Алабама в Мобил. К 22 августа он был там, более чем в 400 милях ниже форта Джексон.
В Мобиле Джексон быстро занялся организацией обороны побережья Мексиканского залива. 27 августа он узнал, что британцы прибыли в Пенсаколу, и сразу же разослал целый ворох писем всем губернаторам региона с просьбой объявить призыв в милицию. В одном из писем он утверждал, что на Бермуды прибыли британские войска численностью 25 тысяч человек и что Россия предоставила для завоевания Луизианы 50 тысяч человек. И ничуть не сомневался относительно намерений британцев, хотя теоретически британские планы были строго секретными и состояли в том, что британцы собирались напасть на Мобил и Новый Орлеан. В письме к командующему в Новом Орлеане Джексон просил его как можно лучше подготовиться к обороне города. Британцы надеялись, что к декабрю они захватят слабо защищенное и плохо организованное побережье Мексиканского залива, но не учитывали ни того, что их намерения очевидны для американцев, ни энтузиазма Джексона.
В самом Мобиле Джексон тоже воодушевлял защитников. Население Мобила составляло менее 1000 человек, и его оборона зависела от форта Боуэр, расположенного в 30 милях от города у входа в залив Мобил. Джексон разместил в форте 160 солдат регулярной армии Соединенных Штатов под командованием майора Вильяма Лауренса. Это был не слишком крепкий форт, на вооружении которого имелось всего двенадцать 9-фунтовых пушек и два орудия более крупного калибра. Но Лауренс сразу же привел его в наилучшее с точки зрения обороны из возможных состояний.
11 сентября капитан Перси отплыл из Пенсаколы, чтобы напасть на форт Боуэр. Его силы состояли из «Гермеса» (22), «Каррона» (20), «Софи» (18) и «Чилдерса» (18), а также отряда сухопутных войск майора Николса, насчитывавшего 60 морских пехотинцев, 12 артиллеристов морской пехоты и 130 индейцев. Британские корабли достигли окрестностей залива Мобил 12 сентября и высадили Николса и его людей в 9 милях восточнее форта Боуэр. Из-за встречного ветра британские корабли не могли преодолеть отмель у входа в залив до 15-го числа, но в тот день американцы из форта Боуэр увидели, что британские корабли на всех парусах идут прямо на форт. Бой начался около 16:00. «Гермес» и «Софи» подошли на расстояние пистолетного выстрела, встали на якорь и сделали бортовые залпы, но другие британские корабли из-за ветра не смогли занять нужное положение. После интенсивного обмена огнем с обеих сторон «Гермес» лишился носового заднего швартова, повернулся носом к форту и сел на мель. Затем он получил тяжелые повреждения от американского огня, хотя в конце концов Перси удалось развернуть его и сделать бортовой залп. В 18:10 «Гермес» попытался отойти от форта на недосягаемое расстояние, но его паруса были изорваны в клочья, такелаж уничтожен, и он снова сел на мель. На этот раз его команду забрали лодки с британской эскадры, и в 19:20 британцы подожгли корабль. Позднее он взорвался. Британские сухопутные силы не пытались захватить форт. Николс, который из-за болезни находился на борту «Гермеса», оказывал помощь на палубе и лишился глаза. В общей сложности «Гермес» потерял 22 человека убитыми и 20 ранеными, «Софи» – 9 человек убитыми и 13 ранеными, а «Каррон» – 1 убитым и 4 ранеными. Американские защитники потеряли всего 4 человека убитыми и 5 ранеными.