Ставки налогов постоянно возрастали: если в начале правления Якуб-бека харадж был 10 %, то потом он возрос до 20 % (а в некоторых местностях — и до 50 %), танапный сбор, составлявший 2 таньга с танапа, возрос до 7–10; хан-дилик был установлен в размере 1 таньга с дома, но вырос до 4 таньга; тари-кара со временем увеличился с 2,5 до 5 % [Куропаткин, 1879а, с. 33–34, 44–45; Forsyth, 1875, р. 97]. Якуб-бек ввел практику передачи сбора налогов на откуп хакимам, что рождало многочисленные злоупотребления со стороны сборщиков. Однако российские очевидцы, в целом критически оценивавшие систему управления при Якуб-беке, отмечали, что взяточничества и лихоимства у него было не больше, чем в других государствах Центральной Азии [Куропаткин, 1879а, с. 41, 44].
Китайские власти после восстановления контроля над Восточным Туркестаном внесли изменения в налогообложение. Отныне поземельный налог не взимался с площади земли, а зависел от собранного урожая. С торговцев налоги вообще не брались, но вводился косвенный налог при покупке скота — «бадж», составлявший 10 % от его стоимости (как в Бухарском эмирате). Предпочтение отдавалось натуральной форме уплаты налогов: зерном, соломой, дровами и проч. [Петровский, 1886, с. 17–19][159]
.Нуждаясь в деньгах и увеличивая налоги, Якуб-бек при этом не способствовал развитию торговли. Внутренняя торговля складывалась стихийно и не была активной: во-первых, были изгнаны китайцы, много делавшие для ее развития; во-вторых, многие товары были изъяты из оборота как противоречащие шариату или не соответствующие качеству; в-третьих, снизилась покупательная способность населения [Белью, 1877, с. 98, 213]. Как писал Т. Форсайт, местные жители говорили ему, что в китайские времена товаров было намного больше [Forsyth, 1875, р. 36]. Внешняя торговля также была ограничена: правитель не позволял караванам выезжать из Йэттишара чаще, чем раз в четыре месяца, особо строго контролируя торговцев, ведущих дела с Российской империей: ведь многие купцы и погонщики караванов нередко отправлялись в российские пределы, чтобы остаться там. Якуб-бек ввел практику «паспортов» (т. е. специальных разрешений на выезд) и залогов («обеспечений») для отправляющихся с караванами и паломников [Беллью, 1877, с. 185–186]. Иностранных же торговцев, прибывавших в Кашгарию без согласования с местными властями, правитель приказывал задерживать и сажать под арест — так, в частности, поступили с несколькими караванами из России, которые получили возможность начать торговать и вернуться лишь после подписания торгового договора Якуб-беком и А. В. Каульбарсом в 1872 г. [Каульбарс, 1872, с. 272].
Правитель Йэттишара довольно много внимания уделял поддержанию коммуникаций, строительству и ремонту дорог и мостов [Белью, 1877, с. 222; Рейнталь, 1869, с. 41; Shaw, 1871, р. 460]. Это было связано с тем, что он, в отличие от китайцев, старался управлять страной, отдавая устные приказы, поэтому ему было необходимо постоянно рассылать многочисленных гонцов в подвластные ему регионы с соответствующими указаниями для правителей [Куропаткин, 1879а, с. 37; Рейнталь, 1870, с. 185]. Вероятно, не в последнюю очередь подобная практика объяснялась тем, что сам Якуб-бек был неграмотен (хотя и производил на иностранцев впечатление образованного человека).
Якуб-бек начал чеканить собственную монету, ставшую основным платежным средством в Йэттишаре. При этом медные монеты (пулы), которые использовались наиболее широко, продолжали чеканиться по образцу прежних, имевших распространение при цинских властях — вероятно, так Якуб-бек пытался добиться доверия населения к новой монете, однако сам навредил себе денежными махинациями. После отказа от сюзеренитета Коканда, Якуб-бек начал изъятие из оборота «кокани» (кокандских таньга), за которые давали по две местных, он же начал принудительно выкупать их по полтаньга за каждую. Затем он приказывал перелить эти деньги в местные, худшего качества, зарабатывая на такой операции вдвое (что, опять же, напоминает о финансовой политике бухарских властей) [Куропаткин, 1879а, с. 52–53; Тухтиев, 1989, с. 19]. Неудивительно, что местные жители с тоской вспоминали времена правления империи Цин, когда на ту же сумму можно было купить втрое больше продуктов или других товаров [Shaw, 1871, р. 470].