В период испанского владычества в Португалии с 1580 по 1640 гг. особое внимание уделялось территориальным поселениям за пределами Европы и добыче ресурсов, а также ограничению и контролю торговли с помощью королевских монополий. Кастильское презрение к мореплаванию, одержимость крестоносной славой и джентльменством способствовали закрепощению португальцев. Получив в 1640 г. независимость, Португалия нуждалась в защите от Испании и голландцев. Англия обеспечила безопасность через неравный союз, скрепленный королевским браком. Англичане заключили мир с Испанией и Республикой, а взамен получили Танжер, Бомбей и доступ к португальским рынкам. Португалия окончательно стала частью морской империи, когда передала Англии эффективный контроль над морской экономикой. Английские военные корабли стали обычным явлением в Лиссабоне - военно-морской базе, обеспечивавшей безопасность морского фланга расширяющейся океанской империи Англии. Английские военно-морские склады и оборудование хранились в крипте великого монастыря короля Мануэля в Белеме, где свободная ниша до сих пор ждет возвращения короля Себастьяна.
После 1640 г. Бразилия возродила империю за счет сахара, табака и золота, торговля которыми осуществлялась в рамках королевских монополий. После 1690 г. бразильское золото стало доминировать в экономике, но большая его часть оказалась в Великобритании для закупки товаров и услуг, которые Португалия не могла предоставить, и поддержания европейской и имперской гарантии безопасности. Португалия не смогла создать военно-морские силы или торговое судоходство, необходимое для обслуживания империи, от которой зависело ее процветание. Торговля была оставлена иностранцам, а "военно-морская служба в Португалии не имела престижа". Опираясь на морскую мощь Великобритании, Португалия продолжала эксплуатировать свои колонии в течение еще одного столетия, пока ее азиатская империя разрушалась под давлением голландцев и англичан. К 1740 г. Гоа оставался одиноким напоминанием об угасших индийских последствиях. После 1700 г. имперское внимание Португалии переключилось на Бразилию - наземную базу власти, а также на западноафриканские работорговые пункты, которые питали плантационную экономику Бразилии. Бразилия принимала на себя основную часть колонизаторских усилий Португалии вплоть до 1820-х годов, когда обретение ею независимости свело империю на нет.
Иезуиты пользовались огромным влиянием в империи после 1640 г., финансируя религиозную деятельность через торговлю при поддержке королевской власти. Маркиз Помбал удалил их в 1760-х годах, серьезно ослабив империю, в которой не хватало светских педагогов и администраторов. Неэффективные королевские торговые монополии потерпели крах, а контрабанда и нелегальная торговля стали основными источниками экономической выгоды для ослабленной империи. Прибыль неизбежно доставалась не Португалии, а Великобритании. Наконец, колония Бразилия обогнала страну-хозяйку. В 1792 г. британский имперский посланник и администратор лорд Макартни пришел к выводу, что будущее Португалии зависит от переноса столицы в Рио-де-Жанейро. Португалия была слабым и уязвимым придатком динамично развивающейся колонии. Макартни, направлявшийся на открытие китайского рынка, ожидал, что деспотичные "коммерческие правила и ограничения" приведут к бразильской революции. Эти монопольные инструменты служили континентальным целям. Агрессивная британская торговля и наполеоновский конфликт ускорили распад империи, для удержания которой у португальцев не хватало ни ума, ни сил.