Совещания и рабочие сборы, проводившиеся в подразделениях Великой армии, также становились предлогом для бесчисленных интриг, в результате которых одни возвышались за счет принижения других. Но хотя эти внутренние распри и вносили некоторый беспорядок, они не мешали армии Наполеона одерживать блестящие победы.
Также в наполеоновской системе ощущалось и отсутствие «теневой власти». Объединения, созданные в консулате (Законодательный корпус и сенат) в противовес ассамблеям, очень быстро прекратили свое существование. Как заметил Ипполит Тэн, Конституция VIII года в основном уничтожила парламентскую власть: «Трибунат обсуждает, но не выносит решений; Законодательный корпус выносит решения, но не обсуждает; консервативный сенат занят поддержкой этого всеобщего паралича». Индивидуальные и профессиональные качества соратников Наполеона также снизились, поскольку сильные личности постепенно отстранялись от дел, и министры становились обычными исполнителями. В 1807 году Талейран был отстранен от поста министра иностранных дел по обвинению в измене, а вместо него был назначен Шампаньи, человек серый и посредственный. В 1810 году ушел в отставку министр внутренних дел Фуше. Найти оправдание немилости, в которую попал маршал Брюн, наоборот, очень трудно. В самом деле, во время кампании в Пруссии в 1807 году Брюн занял Страслунд, потом подписал мирный договор со Швецией. Император не простил ему того, что в этом договоре Брюн упоминал о «французской армии», а не об «Армии Его Императорского и Королевского Величества»!
В ответ на замеченные им первые признаки действий оппозиционно настроенных салонов и закулисной политики Наполеон начал развивать идею заговора против него, имеющего иностранные корни. Он отказывался объяснять недоверие, появившееся в его команде, другими причинами, кроме как периферическими нарушениями:
Основной противовес растущей единоличной власти императора появился в самом правительстве, потому что, по мнению того же Талейрана, «лучший способ свергнуть правительство — это войти в него самому». Получив от Наполеона в 1806 году титул князя Беневентского, Талейран со следующего же года начал отдаляться от своего благодетеля. Так как «министр, которого возвышают, — это министр, который падает», Талейран и Фуше, примкнувший к нему два года спустя, стали ориентировать свои действия на создание большой европейской коалиции. И они добились желаемого, так как Наполеон на острове Эльба говорил: