Несмотря на недовольство реформой, – а любая реформа всегда вызывает противодействие при ее проведении, – корона предприняла в 1647–1648 гг. решительные попытки отменить систему «частного предпринимательства» и заменить ее соответствующим жалованьем. Одновременно с этим было предпринято еще одно нововведение. Дворян на посту капитанов ост-индских кораблей сменили профессиональные моряки. Важнее был их опыт судовождения, а не наличие «голубой крови». В марте 1647 г. Совет по делам заморских владений
Надменное и самоуверенное поведение многих португальских лоцманов, плававших в Индию, вошло в пословицу и стало предметом едкой критики современников эпохи и Диогу ду Коту. Но самые лучшие из лоцманов были непревзойденными в своем ремесле во всем мире, и об их преданности своей профессии свидетельствовал Ричард Хоукинс в своих «Заметках» 1622 г. «Испанцы и португальцы не имеют себе равных в искусстве владения штурвалом; это не идет ни в какое сравнение с тем, что я видел до сих пор. И я хотел бы, чтобы мы следовали во всем их лучшим примерам. Они постоянно находятся в нужном месте на палубе корабля, чтобы следить за его курсом. Лоцман и его помощники ни ночью, ни днем не перестают следить за стрелкой компаса. Они внимательно наблюдают за действиями стоящего у штурвала моряка, подмечая все его ошибки».
На каждом судне полагалось быть опытному врачу и хирургу с запасом всех необходимых лекарств. Но очень часто на борту был всего лишь брадобрей, исполнявший обязанности хирурга, – как это было в 1633 г., когда на четырех кораблях плыли 3 тысячи человек. На каждом судне, согласно королевскому приказу, были полностью укомплектованные аптечные ящики, но очень часто они не использовались по своему прямому назначению. Слишком часто лекарства попадали на черный рынок вместо того, чтобы быть розданными больным. Следует заметить, что многие лекарства были просто вредны, а другие бесполезны. Более того, многие португальские лекари были готовы по всякому поводу пускать больному кровь и давать слабительное, что часто приводило к летальному исходу. Ослабленный из-за плохого питания и болезней человек терял несколько пинт крови и страдал от обезвоживания организма. Распространение различных инфекционных заболеваний среди живших в ужасной скученности и антисанитарных условиях солдат и осужденных и, кроме того, в отсутствие укрытия от тропической жары неизбежно вели к высокой смертности среди матросов от дизентерии, тифа, лихорадки и цинги.
Диогу ду Коту сообщает, что во время плавания из Лиссабона в Индию в 1571 г. из 4 тысяч умерли 2 тысячи человек. За шесть лет с 1629 по 1634 г. из 5228 солдат, погрузившихся на корабли в Лиссабоне, отплывавших в Индию, только 2495 достигли Гоа. На обратном пути смертельных случаев обычно было гораздо меньше, поскольку суда не были настолько переполнены и большинство пассажиров были уже привычны к тяготам пути. Потери в пути возрастали, если в силу обстоятельств судам приходилось заходить на остров Мозамбик и экипаж с пассажирами сходили на берег. С 1528 по 1558 г. за 30 лет там умерло свыше 30 тысяч человек, в основном от малярии и лихорадки, вызывавшей разлитие желчи.
Итальянский иезуит Алессандро Валиньяно, бывший участником морского перехода в 1574 г., заметил: «Поражает тот факт, как часто и легко португальцы решаются на путешествие в Индию… Каждый год 4 или 5 переполненных людьми каракк отплывают из Лиссабона, и многие ведут себя так, будто отправляются в поездку на расстояние не далее чем на одну лигу от столицы, имея на себе одну рубашку и взяв с собой только хлеб и сыр в качестве провизии».