Вирусы. Драйверы эволюции. Друзья или враги?

Определенные эпитопы, на которые нацелен иммунный ответ у одного инфицированного больного, могут отличаться от эпитопов другого благодаря генетическим различиям в структуре иммунитета. Так происходит в результате отбора, улучшающего адаптацию вируса к конкретному индивиду-хозяину, но это не гарантирует, что новоприобретенный генотип будет обладать селективным преимуществом в организме следующего хозяина. Генетическая информация инфицирующего вируса несет на себе несмываемый отпечаток воздействия иммунной системы предыдущего хозяина. Наиболее влиятельными генетическими факторами хозяина (по меньшей мере при нашем современном понимании), действующими в гонке вооружений между вирусом и иммунной системой, являются аллели HLA класса I. Это определяет способность иммунной системы распознавать вирусные эпитопы посредством цитотоксических Т-клеток. Образованные из вирусного белка пептиды дифференциально представляются как цели для Т-клеток в зависимости от HLA-аллелей хозяина. Обладание избранными HLA-гаплотипами, как выяснилось, полезно для некоторых индивидов, так как позволяет им более эффективно подавлять репликацию вирусных частиц, в то время как другие индивиды такими гаплотипами не обладают. Пептиды CTL-эпитопов главного структурного белка Gag ВИЧ-1 служат основными мишенями для клеточно-опосредованного иммунитета, а значит, являются объектами мощного давления отбора посредством мутаций. Этот белок в высшей степени консервативен и имеет несколько важных структурных и функциональных доменов. Считается, что CTL-распознавание пептидов внутри критически важных структур этого белка является преимуществом для хозяина. Мутации для избегания иммунного ответа, которые изменяют эти эпитопы, должны снижать адаптивность вируса и в результате подавлять способность к репликации. В самом деле, это представляется весьма вероятным; индивиды, демонстрирующие эффективный и обширный CTL-ответ на Gag CTL-эпитопы, отличаются меньшим содержанием вирусов в тканях организма (Edwards et al., 2002; Ramduth et al., 2005). Эти реакции особенно эффективны у больных с благоприятными аллелями HLA-I в HLA-B.