Новый удел, выделившись из старого, стремился сделаться самостоятельным и в церковном отношении, а потому стремился завести у себя особую епархию, потому что гражданская самостоятельность без церковной казалась неполной. Так, в XII веке после выделения новых удельных княжеств из старых, из Переяславского удела – Смоленского, из Волыни – Галицкого, из Черниговского – Рязанского, явились и новые епархии, Смоленская – в 1137 году, Галицкая – в 1157 году, Рязанская – в 1198 году. С падением удела упразднялась и епархия; например, в конце XI века после разорения половцами Тмутаракани пала и тамошняя епархия. Возвышение земли возвышало и ее епархию; в 1165 году богатый Новгород выхлопотал своему владыке Иоанну титул архиепископа, – тогда еще первый и единственный на Руси.
Из числа епископов того времени только немногие известны по имени. Известны оба Новгородские: Иоаким Корсунянин (992–1030) и Лука Жидята (1035–1059); из Ростовских – только два: Феодор (поставленный в 992 году) и Иларион, бывший его преемником еще при святом Владимире и вскоре оставивший свою паству; из Черниговских – только один: Неофит (992); из Владимирских на Волыни – также один: Стефан (992) и из Белгородских – один: Никита (992). В Ростове в 1157 году горожане изгнали епископа Нестора, недовольные его строгим увещеванием по поводу постов в среду и пятницу. В 1159 году та же участь за еще более принципиальную позицию в отношении однодневных постов постигает Ростовского епископа Леонтия, которого обвинили в поборах по отношению к церквям и духовенству.
Кто были родом все эти архипастыри? Первоначально князь Владимир привел с собой священников из Корсуня, а царевна Анна привезла с собой своих священников. О первых епископах, присланных к нам при святом Владимире, в Иоакимовской летописи замечено, будто они были из славян болгарских. Многие священнослужители, прежде всего епископы и даже митрополит Михаил были призваны из Болгарии. Прислать к нам таких епископов для первоначального насаждения веры требовало христианское благоразумие. Найти для этого способных людей между болгарами было нетрудно, потому что в Болгарии значительно процветали уже тогда и христианская вера, и христианское просвещение. Ростовский епископ Иларион избран был из цареградского клира и вскоре возвратился в Царьград, следовательно, по всей вероятности, был грек. Новгородский Лука Жидята – вот первый русский, удостоившийся святительского сана по воле великого князя Ярослава.
Но всего этого числа было недостаточно для крещения и обучения людей в Киеве и других местах. Однако даже большее количество призванных священников не могло удовлетворить потребности в них, надо было увеличить число русских священников, а это не могло произойти иначе, чем через специальное обучение. Такое обучение было организовано сразу после всенародного крещения в Киеве. Для этого, по свидетельству летописца, по приказу Владимира, у лучших граждан отбирали детей и отдавали учиться к священникам при церквях.
В XII веке вошло уже в обычай, признанный повсеместно, ставить епископов не иначе, как по избранию удельных князей и народа. В 1183 году Всеволод III не принял назначенного в Ростов епископа Николая Грека, потому что митрополит Никифор при его назначении не испросил согласия князя и народа. В княжеских уделах главный голос при избрании епископа принадлежал князьям, а в Новгороде, где вече было сильнее князя, с XII века установилось народное избрание владык. В этих выборах обыкновенно участвовали князь, духовенство, софияне (лица, принадлежавшие к ведомству Софийского собора и владычной кафедры) и народ. В случае несогласия избирателей прибегали к жребию. Для этого жребии избираемых претендентов клали на престол святой Софии и посылали вынимать их слепца или младенца; первый вынутый жребий обозначал избранника святой Софии. Избранного владыку посылали в Киев для посвящения.
Каждый епископ в пределах своей епархии был первым и самым влиятельным человеком не только в делах духовных, но и во всех гражданских делах. Он был также нужен для удельной области, как и князь. Новгородцы не могли себя представить без владыки. С благословения местного святителя делались все дела, так что он невольно втягивался во все местные земские проблемы. Зависимость епископов от митрополита была не велика, ограничиваясь почти одним только их поставлением на епархию. Митрополит вмешивался в их дела весьма редко, только в особых случаях и по каким-нибудь жалобам. Делами своей епархии каждый из епископов управлял вполне самостоятельно, при помощи своих наместников из почетных духовных лиц, своего «клироса» или соборных священников, составлявших при нем постоянный кафедральный совет, и светских десятильников по разным епархиальным округам, заведовавших главным образом архиерейскими сборами с округов. В распоряжении епископы находились городские и сельские священники – белое духовенство. Священники крупных храмов – соборов, а также местных церквей являлись организаторами религиозной жизни в городах и селах.