Совокупность мер против большой Реформации, принятых папством в 16 – 17 вв., называют контрреформацией
(см. Протестантизм); феодально-католическая реакция на появление и распространение протестантизма. Опыт, накопленный католической церковью в подавлении средне-вековых ересей, был распространен и на истребление протестантизма, хоть и не столь успешно. В контрреформации использовались инквизиция, монашеские ордена, как прежние, так и вновь созданные, помощь светских феодалов. Инквизиции был придан статус одной из конгрегаций Святого престола, действующей под непосредственным руководством папы. Она представляла собою последнюю судебную инстанцию по делам о ереси и повсеместно учиняла массовую расправу над протестантами. Активно включается в контрреформацию созданный в 1534 – 1540 гг. орден иезуитов, а также ордена кармелитов, ораторианцев, барнабитов, урсулинок и др. При их поддержке и с участием ультрамонтанов на Тридентском соборе в 1545 – 1563 гг. за папой признается высший и безусловный авторитет в делах веры, принимается догмат «опус оператум», направленный против лютеранского учения об «оправдании только верою», подтверждаются отвергнутые протестантами положения вероучения и элементы культа, вводится строгая церковная цензура, в 1559 г. учреждается «Индекс запрещенных книг». В ходе контррефорации реорганизуется папская курия, вносятся уточнения в каноническое право, редактируются богослужебные книги. В Риме создаются новые учебные заведения (семинарии, коллегии) для специальной подготовки духовенства, направляемого в страны наибольшего распространения протестантизма: Германикум (1552 г.), Ангеликум (1578 г.) и пр. Усиливается деятельность католических миссий в заморских владениях европейских держав и некатолических странах, для чего учреждается Конгрегация пропаганды веры (позднее переименованная в Конгрегацию евангелизации народов). Но контрреформация не ограничивается чисто церковными мерами. К ней подключаются выступающие под знаменем католицизма монархи и правительства. Разгораются религиозные войны 16 – 17 вв., охватывающие Францию, Испанию, Германию, Чехию, Польшу, приведшие вместе с истреблением протестантов к длительной разрухе, голоду, хаосу. Контрреформация включала также ожесточенную борьбу католической реакции против светской науки и научного мировоззрения, преследование передовых мыслителей (Дж.Бруно, Г.Галилей, Д.Ванини и др.) и, кроме того «охоту за ведьмами», принимающую порой характер массового психоза. Конрреформация отчасти укрепила положение папства, задержала распространения протестантизма в отдельных странах, а кое-где вообще привела к тому, что протестанты были уничтожены, возвращены в лоно католической церкви или изгнаны. Но желанная цель контрреформации – отвоевание утраченных папством позиций, восстановление единства западного христианства – не была достигнута. Протестантизм так и остался непобежденной ересью и отстоял право на свое дальнейшее существование и развитие как 3-го из основных направлений христианства.Отколовшихся от различных направлений восточного христианства (православия, монофизитства, несторианства, монофелитства) и имеющих унию (союз) с католической церковью, называют католическими церквями восточного обряда.
Они признают верховную власть папы и основные догматы католицизма, сохраняя свою традиционную обрядность, церковную организацию и литургический язык. Монофелитство возникло в начале 7 в. и утверждало, что Христос имел 2 разные сущности: божественную и человеческую, но единую волю. Монофелитство было осуждено на VI Вселенском соборе в 680 г., провозгласившем, что богочеловек имеет 2 воли, причем его человеческая воля подчинена божественной. Из монофелитства выделились марониты (нач. 8 в.), которые в 16 в. присоединились к католицизму. К 21 в. имелись католические церкви восточного обряда: маронитская, греко-католическая (мелькитская), халдейская (сиро-халдейская или ассиро-халдейская), сиро-католическая, армяно-католическая, копто-католическая. Приверженцы католических церквей восточного обряда живут в основном в странах Ближнего Востока: Ливане, Сирии, Турции, Иордании, Израиле, Египте, но имеют общины и в др. районах.