С 1559 г. по 1966 г. Ватикан издал «Индекс запрещённых книг
» – список произведений, чтение которых запрещалось верующим под угрозой отлучения от церкви. В «Индекс запрещённых книг» включались тысячи названий, среди которых находились произведения выдающихся мыслителей ученых, писателей (например, «Монархия» Данте, «Декамерон» Боккаччо, книги О.Бальзака, Ж.Сартра, сочинения Абеляра, Экхарта, Мальбранша, Спинозы, Канта, книга Д.Штрауса «Жизнь Иисуса» и многие другие). С 1966 г. издание «Индекса запрещенных книг» прекращено. К 21 в. церковь, стремясь сохранить контроль над духовной жизнью общества использует другие формы и методы ограждения верующих от влияния опасных, с её точки зрения, произведений науки, литературы и искусства.
В конце 19 в. среди католических богословов и части интеллигенции, которые пытались привести католическую доктрину в соответствие с достижениями современной науки и культуры, возникло движение – католический модернизм
(от франц. – современный). В нём было 3 течения: доктринальный или теологический модернизм; исторический модернизм, стремившийся пересмотреть церковную историю на основе новейших открытий, особенно в области археологии и изучения древних языков и культур; и политический модернизм. Католический модернизм был реакцией на стремление церковного руководства добиться единства между верой, культурой и жизнью Нового времени на основе неотомизма. Модернисты понимали Библию как исторический памятник, несущий на себе печать того времени, в которое создавались её книги. Они отвергли схоластический метод философствования и попытались поставить теологию в связь с современной философией («философией действия» М.Блонделя, прагматизмом У.Джемса, интуитивизмом А.Бергсона). Наиболее значительными представителями модернизма во Франции были А.Луази, М.Блондель, Э.Миньо, Л.Лабертоньер, в Италии – Р.Мурри, А.Фогаццаро, в Англии – Ф.фон Хюгель и Дж.Тирелл. Ватикан видел наибольшую опасность модернизма в отрицании последним сверхъестественного характера откровения и церкви. Применив к Ветхому и Новому завету принцип историзма и эволюционизма, модернисты подорвали веру в их богооткровенный характер, а отделив «Христа веры от Христа истории», они показали, что непорочное зачатие, вознесение Христа, его чудеса и т.д. имеют значение только для веры, но ничего не значат для истории. Католический модернизм был решительно осужден папой Пием X сначала в декрете Священной канцелярии (см. инквизиция) «Ламентабили», а затем в энциклике «Пашенди» (1907 г.). Под знаком осуждения модернизма прошли многие десятилетия, вплоть до нового осуждения обновленческих тенденций в энциклике папы Пия XII «Гумани генерис» (1950г.).