В связи со смертью патриарха Сергия и необходимостью избрания нового главы РПЦ был созван Поместный собор РПЦ 1945 г.
в одном из храмов Москвы при участии глав и представителей глав многих поместных православных церквей. Был заслушан и обсуждён доклад патриаршего местоблюстителя митрополита Алексия (Симанского) о патриотической деятельности РПЦ в период Великой Отечественной войны. На соборе было принято «Положение об управлении РПЦ», которым Московская патриархия руководствовалась до 1988 г. Положение состояло из 4 разделов: в 1-м определялись порядок избрания, основные права и обязанности главы РПЦ – патриарха Московского и всея Руси; 2-й раздел был посвящён деятельности и порядку формирования Священного синода; 3-й и 4-й – регламентировали устройство и деятельность органов епархиального и приходского управления. Собор избрал Алексия I (1877 – 1970 гг.) патриархом Московским и всея Руси, который возглавлял РПЦ в течение 25 лет; скончался в Москве; погребён в Троице-Сергиевой лавре.По постановлению синода РПЦ в связи со смертью в апреле 1970 г. патриарха Алексия I был созван Поместный собор РПЦ 1971 г.
Собор проходил с 30 мая по 2 июня 1971 г. в Троице-Сергиевой лавре; на нём присутствовали главы и представители почти всех поместных православных церквей. Собор своими решениями одобрил межсоборную деятельность синода, выразил удовлетворённость ликвидацией Брестской и Ужгородской уний, предоставлением автокефалии Американской православной церкви и автономии – Японской. Было принято решение «об отмене клятв на старые обряды и на придерживающихся их», которое подвело черту под 3-вековой конфронтацией РПЦ со старообрядцами. Главой РПЦ был единогласно избран Пимен (Извеков, 1910 – 1990 гг.); скончался в Москве, погребён в Троице-Сергиевой лавре.После Поместного собора 1971 г. богословами РПЦ была взята на вооружение концепция – умеренное обновление
, согласно которой правомерными и полезными для православия признаются лишь новшества, не ставящие под угрозу ни один жизненно важный элемент церковной структуры и не отвергающие ни одну из определяющих религиозных идей. В концепции особо подчёркивается необходимость постепенности в проведении церковных реформ, обязательности обеспечения их общецерковной (соборной) санкцией. Обновление церкви «должно совершаться в духе смиренного сознания необходимости соборным разумением устранить те исторически возникшие неточности или преувеличения в методах или результатах богословствования, которые… становятся ныне своего рода помехами» (Журнал Московской патриархии, 1972, №12, с.58). Это обновление должно идти исключительно церковным путём и церковными средствами.Основным документом, определяющим устройство и порядок управления РПЦ, является Устав РПЦ
, принятый на Поместном соборе в 1988 г. и заменивший «Положение об управлении РПЦ». Устав состоит из 15 разделов. В первых 6-ти рассматриваются порядок образования, устройства, права и обязанности органов высшего церковного управления: Поместного и Архиерейского соборов, патриарха, Священного синода и синодальных учреждений. 7-й и 8-й разделы посвящены епархиальному и приходским органам управления. В остальных – рассматриваются вопросы деятельности монастырей, духовных школ, заграничных церковных учреждений, пенсионного обеспечения духовенства и имущественные и финансовые проблемы.